Zastosowanie metody multipleksowego minisekwencjonowania (multiplex minisequencing) do wykrywania mutacji w ludzkim genie CYP21

Abstract

Poddaliśmy analizie siedem najczęściej występujących mutacji genu CYP21B, odpowiedzialnych za wrodzony przerost kory nadnerczy (WPN, ang. CAH), wykorzystując metodę multipleksowego minisekwencjonowania. Sekwencje funkcjonalnego genu CYP21B namnożone zostały przy użyciu pary primerów, zapobiegających amplifikacji pseudogenu CYP21P lub hybryd pseudogenu CYP21B i genu CYP21P. Minisekwencjonowanie multipleksowe (SNaPShot PCR) wykonano z użyciem fluorescencyjnie znakowanych dideoksynukleotydów ([F]ddNTPs) i oryginalnie zaprojektowanych primerów, komplementarnych do miejsc występowania siedmiu najczęstszych mutacji, odpowiedzialnych za objawy WPN. W pięciu sposród siedmiu analizowanych miejsc mutacji stwierdziliśmy pięć nieopisanych dotąd substytucji o nieznanym wpływie na przebieg choroby. W porównaniu do klasycznych metod analizy polimorfizmu pojedynczych podstawień, multiplex minisequencing jest metodą równie specyficzną i czułą, ale znacznie szybszą. Metoda jest szczególnie polecana do populacyjnej, przesiewowej analizy znanych miejsc mutacji.

Keywords

• SNaPShot PCR
• gen CYP21