Genetic Variability in the E6/E7 Region of Human Papillomavirus 16 in Women from Ecuador
Alicia Zhingre,
César Bedoya-Pilozo,
Diana Gutiérrez-Pallo,
Inés Badano,
Andrés Herrera-Yela,
Zoila Salazar,
Damaris Alarcón,
Natali Argüello-Bravo,
Maylen Espinoza,
Patricio Ponce,
Yudira Soto,
Andrés Carrazco-Montalvo
Affiliations
Alicia Zhingre
Laboratorio de Biotecnología, Universidad Católica de Cuenca, Cuenca 010107, Ecuador
César Bedoya-Pilozo
Hospital Luis Vernaza, Guayaquil 090306, Ecuador
Diana Gutiérrez-Pallo
Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Centro de Referencia Nacional de Genómica, Secuenciación y Bioinformática, Quito 170403, Ecuador
Inés Badano
Laboratorio de Antropología Biológica y Bioinformática Aplicada, Red de Laboratorios, Universidad Nacional de Misiones and Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Posadas N3300, Argentina
Andrés Herrera-Yela
Facultad de Ingeniería, Maestría en Biología Computacional, Pontificia Universidad Católica del Ecuador, Quito 170803, Ecuador
Zoila Salazar
Laboratorio de Biotecnología, Universidad Católica de Cuenca, Cuenca 010107, Ecuador
Damaris Alarcón
Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Centro de Referencia Nacional de Genómica, Secuenciación y Bioinformática, Quito 170403, Ecuador
Natali Argüello-Bravo
Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Laboratorio de Influenza y Otros Virus Respiratorios, Quito 170403, Ecuador
Maylen Espinoza
Hospital IESS CEIBOS, Guayaquil 090615, Ecuador
Patricio Ponce
Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Gestión de Investigación, Desarrollo e Innovación, Quito 170403, Ecuador
Yudira Soto
Instituto de Medicina Tropical “Pedro Kouri”, Laboratorio de Infecciones de Transmisión Sexual, Departamento de Virología, Autopista Novia del Mediodía Km 6 ½, La Habana 10100, Cuba
Andrés Carrazco-Montalvo
Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Centro de Referencia Nacional de Genómica, Secuenciación y Bioinformática, Quito 170403, Ecuador
Human Papillomavirus (HPV) infection is associated with intraepithelial neoplasia and cervical cancer (CC). Ecuador has a high prevalence of cervical cancer, with more than 1600 new cases diagnosed annually. This study aimed to analyze oncogenes E6 and E7 of HPV16 in samples collected from women with cancerous and precancerous cervical lesions from the Ecuadorian coast. Twenty-nine women, including six with ASCUS, three with LSIL, thirteen with HSIL, and seven with Cacu, were analyzed. The most common SNPs were E6 350G or L83V (82.6%) and E6 145T/286A/289G/335T/350G or Q14H/F78Y/L83V (17.4%). Both variants are reported to be associated with an increased risk of cervical cancer in worldwide studies. In contrast, all E7 genes have conserved amino-acid positions. Phylogenetic trees showed the circulation of the D (26.1%) and A (73.9) lineages. The frequency of D was higher than that reported in other comparable studies in Ecuador and Latin America, and may be related to the ethnic composition of the studied populations. This study contributes to the characterization of the potential risk factors for cervical carcinogenesis associated with Ecuadorian women infected with HPV16.
