Sovremennye Issledovaniâ Socialʹnyh Problem (Oct 2013)
ПОТЕНЦИАЛЬНАЯ РОЛЬ ЭПИГЕНЕТИЧЕСКИХ ФАКТОРОВ В ИНАКТИВАЦИИ ГЕНА DUSP9 ПРИ СВЕТЛОКЛЕТОЧНОЙ КАРЦИНОМЕ ПОЧКИ
Abstract
DUSP9 относится к семейству биспецифических протеинфосфатаз, которые могут дефосфорилировать, и таким образом инактивировать различные МАР-киназы. DUSP9 преимущественно экспрессируется в плаценте и эмбриональной печени. В постнатальный период экспрессия гена в основном происходит в почке. Ранее было показано, что уровень экспрессии DUSP9 значительно снижен в ткани светлоклеточной карциномы почки. Целью данной работы является выяснение роли эпигенетических факторов, таких как метилирование ДНК и модификация гистонов, в регуляции тканеспецифичной экспрессии DUSP9. Используя метод COBRA, мы исследовали характер метилирования ДНК в промоторном и внутригенном районах DUSP9 в различных тканях, отличающихся по экспрессии гена. Нами не было выявлено различий в метилировании геномных участков между тканями. Независимо от уровня транскрипции DUSP9, ДНК в геномном локусе во всех проанализированных тканях гипометилирована. Анализируя данные эпигеномных исследований ENCODE, была выявлена связь активности DUSP9 c определенными модификациями гистонов в локусе гена. В клетках, в которых ген активен, хроматин связан с H3K4me3, в то время как в клетках, в которых ген не экспрессируется, хроматин ассоциирован с маркером репрессии H3K27me3. Таким образом, возможно, что активность гена DUSP9 может регулироваться путем модификации гистонов.DOI: http://dx.doi.org/10.12731/2218-7405-2013-9-28