Journal of Microbiology, Immunology and Infection (Oct 2023)
Implication of myddosome complex genetic variants in outcome severity of COVID-19 patients
- Laura E. Martínez-Gómez,
- Carlos Martinez-Armenta,
- Daniel Medina-Luna,
- María Luisa Ordoñez-Sánchez,
- Tere Tusie-Luna,
- Silvestre Ortega-Peña,
- Brígida Herrera-López,
- Carlos Suarez-Ahedo,
- Guadalupe Elizabeth Jimenez-Gutierrez,
- Alberto Hidalgo-Bravo,
- Paola Vázquez-Cárdenas,
- Rosa P. Vidal-Vázquez,
- Juan P. Ramírez-Hinojosa,
- Pilar Miyoko Martinez Matsumoto,
- Gilberto Vargas-Alarcón,
- Rosalinda Posadas-Sánchez,
- José-Manuel Fragoso,
- Felipe de J. Martínez-Ruiz,
- Dulce M. Zayago-Angeles,
- Mónica Maribel Mata-Miranda,
- Gustavo Jesús Vázquez-Zapién,
- Adriana Martínez-Cuazitl,
- Javier Andrade-Alvarado,
- Julio Granados,
- Luis Ramos-Tavera,
- María del Carmen Camacho-Rea,
- Yayoi Segura-Kato,
- José Manuel Rodríguez-Pérez,
- Roberto Coronado-Zarco,
- Rafael Franco-Cendejas,
- Luis Esau López-Jácome,
- Jonathan J. Magaña,
- Marcela Vela-Amieva,
- Carlos Pineda,
- Gabriela Angélica Martínez-Nava,
- Alberto López-Reyes
Affiliations
- Laura E. Martínez-Gómez
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Carlos Martinez-Armenta
- Graduate Program in Experimental Biology, Dirección de Ciencias Biológicas y de la Salud (DCBS), Universidad Autónoma Metropolitana Iztapalapa, Ciudad de México, Mexico
- Daniel Medina-Luna
- Microbiology & Immunology Department, Dalhousie University, Halifax, B3H4R2, Nova Scotia, Canada
- María Luisa Ordoñez-Sánchez
- Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico
- Tere Tusie-Luna
- Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico; Instituto de Investigaciones Biomédicas Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico
- Silvestre Ortega-Peña
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Brígida Herrera-López
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Carlos Suarez-Ahedo
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Guadalupe Elizabeth Jimenez-Gutierrez
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Alberto Hidalgo-Bravo
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Paola Vázquez-Cárdenas
- Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
- Rosa P. Vidal-Vázquez
- Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
- Juan P. Ramírez-Hinojosa
- Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
- Pilar Miyoko Martinez Matsumoto
- Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
- Gilberto Vargas-Alarcón
- Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
- Rosalinda Posadas-Sánchez
- Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
- José-Manuel Fragoso
- Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
- Felipe de J. Martínez-Ruiz
- Nuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México ISSSTE, Mexico
- Dulce M. Zayago-Angeles
- Nuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México ISSSTE, Mexico
- Mónica Maribel Mata-Miranda
- Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
- Gustavo Jesús Vázquez-Zapién
- Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
- Adriana Martínez-Cuazitl
- Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
- Javier Andrade-Alvarado
- Servicio de Cirugía General, Hospital Central Norte Petróleos Mexicanos (PEMEX), Estado de México, Mexico
- Julio Granados
- Departamento de Inmunogenética, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
- Luis Ramos-Tavera
- Departamento de Inmunogenética, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
- María del Carmen Camacho-Rea
- Departamento de Nutrición Animal, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
- Yayoi Segura-Kato
- Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico
- José Manuel Rodríguez-Pérez
- Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
- Roberto Coronado-Zarco
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Rafael Franco-Cendejas
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Luis Esau López-Jácome
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Jonathan J. Magaña
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Marcela Vela-Amieva
- Laboratorio de Errores Innatos del Metabolismo y Tamiz, Instituto Nacional de Pediatría, Secretaria de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Carlos Pineda
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
- Gabriela Angélica Martínez-Nava
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico; Corresponding author.
- Alberto López-Reyes
- Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico; Corresponding author.
- Journal volume & issue
-
Vol. 56,
no. 5
pp. 939 – 950
Abstract
Background/purpose(s): During a viral infection, the immune response is mediated by the toll-like receptors and myeloid differentiation Factor 88 (MyD88) that play an important role sensing infections such as SARS-CoV-2 which has claimed the lives of more than 6.8 million people around the world. Methods: We carried out a cross-sectional with a population of 618 SARS-CoV-2-positive unvaccinated subjects and further classified based on severity: 22% were mild, 34% were severe, 26% were critical, and 18% were deceased. Toll Like Receptor 7 (TLR7) single-nucleotide polymorphisms (rs3853839, rs179008, rs179009, and rs2302267) and MyD88 (rs7744) were genotyped using TaqMan OpenArray. The association of polymorphisms with disease outcomes was performed by logistic regression analysis adjusted by covariates. Results: A significant association of rs3853839 and rs7744 of the TLR7 and MyD88 genes, respectively, was found with COVID-19 severity. The G/G genotype of the rs3853839 TLR7 was associated with the critical outcome showing an Odd Ratio = 1.98 (95% IC = 1.04–3.77). The results highlighted an association of the G allele of MyD88 gene with severe, critical and deceased outcomes. Furthermore, in the dominant model (AG + GG vs. AA), we observed an Odd Ratio = 1.70 (95% CI = 1.02–2.86) with severe, Odd Ratio = 1.82 (95% CI = 1.04–3.21) with critical, and Odd Ratio = 2.44 (95% CI = 1.21–4.9) with deceased outcomes. Conclusion: To our knowledge this work represents an innovative report that highlights the significant association of TLR7 and MyD88 gene polymorphisms with COVID-19 outcomes and the possible implication of the MyD88 variant with D-dimer and IFN-α concentrations.