Ciência Rural (Sep 2013)

Quadrados mínimos parciais uni e multivariado aplicados na seleção genômica para características de carcaça em suínos

  • Camila Ferreira Azevedo,
  • Fabyano Fonseca e Silva,
  • Marcos Deon Vilela de Rezende,
  • Luiz Alexandre Peternelli,
  • Simone Eliza Facione Guimarães,
  • Paulo Sávio Lopes

DOI
https://doi.org/10.1590/S0103-84782013000900017
Journal volume & issue
Vol. 43, no. 9
pp. 1642 – 1649

Abstract

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A principal contribuição da genética molecular é a utilização direta das informações de DNA no processo de identificação de indivíduos geneticamente superiores. Sob esse enfoque, idealizou-se a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection - GWS), a qual consiste na análise de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma. Devido a esse grande número de SNPs, geralmente maior que o número de indivíduos genotipados, e à alta colinearidade entre eles, métodos de redução de dimensionalidade são requeridos. Dentre estes, destaca-se o método de regressão via Quadrados Mínimos Parciais (Partial Least Squares - PLS), que além de solucionar tais problemas, permite uma abordagem multivariada, considerando múltiplos fenótipos. Diante do exposto, objetivou-se aplicar e comparar a regressão PLS univariada (UPLS) e multivariada (MPLS) na GWS para características de carcaça em uma população F2 de suínos Piau×Comercial. Os resultados evidenciaram a superioridade do método MPLS, uma vez que este proporcionou maiores valores de acurácia em relação à abordagem univariada.

Keywords