Multi-tissue Siberian sturgeon RNA sequencing data
Christophe Klopp,
Cédric Cabau,
André Lasalle,
Santiago Di Landro,
Gonzalo Greif,
Denise Vizziano-Cantonnet
Affiliations
Christophe Klopp
INRAE, SIGENAE, MIAT UR875, F-31326, Castanet Tolosan, France, ‘SIGENAE, GenPhySE, Université de Toulouse, INRAE, ENVT, F-31326, Castanet Tolosan, France
Cédric Cabau
Laboratorio de Interacción Hospedero-Patógeno/Unidad de Biología Molecular, Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay
André Lasalle
Laboratorio de Fisiología de la Reproducción y Ecología de Peces, Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de la República Oriental del Uruguay, Iguá 4225, Montevideo, 11400, Uruguay
Santiago Di Landro
Laboratorio de Fisiología de la Reproducción y Ecología de Peces, Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de la República Oriental del Uruguay, Iguá 4225, Montevideo, 11400, Uruguay
Gonzalo Greif
Laboratorio de Interacción Hospedero-Patógeno/Unidad de Biología Molecular, Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay
Denise Vizziano-Cantonnet
Laboratorio de Fisiología de la Reproducción y Ecología de Peces, Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de la República Oriental del Uruguay, Iguá 4225, Montevideo, 11400, Uruguay; Corresponding author.
Siberian sturgeon, Acipenser baerii, is a commercially valuable fish for flesh and caviar production and a threatened species. We produced transcriptomic data for ten tissues with relevance to puberty, reproduction, early development, growth and food intake. The data includes RNA-Seq read sets of brain, pituitary, anterior-kidney, kidney, stomach, liver, heart, embryonic, pre-larval, and immature gonad sequences. Tissues were collected from sex differentiated fish (17 to 42 months of age, 66 to 85 cm) RNA was extracted and sequenced. Our purpose is to facilitate fundamental studies of sturgeon physiology to wild and aquaculture populations management.
