G3: Genes, Genomes, Genetics (Mar 2023)
An improved assembly of the pearl millet reference genome using Oxford Nanopore long reads and optical mapping
- Marine Salson,
- Julie Orjuela,
- Cédric Mariac,
- Leïla Zekraouï,
- Marie Couderc,
- Sandrine Arribat,
- Nathalie Rodde,
- Adama Faye,
- Ndjido A Kane,
- Christine Tranchant-Dubreuil,
- Yves Vigouroux,
- Cécile Berthouly-Salazar
Affiliations
- Marine Salson
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Julie Orjuela
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Cédric Mariac
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Leïla Zekraouï
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Marie Couderc
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Sandrine Arribat
- Centre National de Ressources Génomiques Végétales (CNRGV), Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE), 31320 Castanet-Tolosan, France
- Nathalie Rodde
- Centre National de Ressources Génomiques Végétales (CNRGV), Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE), 31320 Castanet-Tolosan, France
- Adama Faye
- Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la sécheresse (CERAAS), Institut Sénégalais de Recherches Agricoles (ISRA), BP 3320 Thiès, Sénégal
- Ndjido A Kane
- Centre d’Etude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la sécheresse (CERAAS), Institut Sénégalais de Recherches Agricoles (ISRA), BP 3320 Thiès, Sénégal
- Christine Tranchant-Dubreuil
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Yves Vigouroux
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- Cécile Berthouly-Salazar
- DIADE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), 34394 Montpellier, France
- DOI
- https://doi.org/10.1093/g3journal/jkad051
- Journal volume & issue
-
Vol. 13,
no. 5
Abstract
AbstractPearl millet (Pennisetum glaucumCenchrus americanus