Genomic Landscape of Breast Cancer: Study Across Diverse Ethnic Groups
Asbiel Felipe Garibaldi-Ríos,
Luis E. Figuera,
Guillermo Moisés Zúñiga-González,
Belinda Claudia Gómez-Meda,
Ana María Puebla-Pérez,
Alicia Rivera-Cameras,
María Teresa Magaña-Torres,
José Elías García-Ortíz,
Ingrid Patricia Dávalos-Rodríguez,
Mónica Alejandra Rosales-Reynoso,
Patricia Montserrat García-Verdín,
Irving Alejandro Carrillo-Dávila,
Blanca Miriam Torres-Mendoza,
Guadalupe Ávalos-Navarro,
Martha Patricia Gallegos-Arreola
Affiliations
Asbiel Felipe Garibaldi-Ríos
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Luis E. Figuera
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Guillermo Moisés Zúñiga-González
División de Medicina Molecular, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Col. Independencia, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Belinda Claudia Gómez-Meda
Departamento de Biología Molecular y Genómica, Instituto de Genética Humana “Dr. Enrique Corona Rivera”, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Ana María Puebla-Pérez
Departamento de Farmacobiología, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías, Universidad de Guadalajara, Guadalajara 44430, Jalisco, Mexico
Alicia Rivera-Cameras
Departamento Ciclo de Vida, Genética y Medicina Genómica, Unidad Académica de Ciencias de la Salud, Universidad Autónoma de Guadalajara, Guadalajara 45129, Jalisco, Mexico
María Teresa Magaña-Torres
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
José Elías García-Ortíz
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Ingrid Patricia Dávalos-Rodríguez
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Mónica Alejandra Rosales-Reynoso
División de Medicina Molecular, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Col. Independencia, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Patricia Montserrat García-Verdín
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Irving Alejandro Carrillo-Dávila
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Blanca Miriam Torres-Mendoza
Laboratorio de Inmunodeficiencias Humanas y Retrovirus, División de Neurociencias, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Guadalupe Ávalos-Navarro
Departamento de Ciencias Médicas y de la Vida, Centro Universitario de la Ciénega, Universidad de Guadalajara, Av. Universidad 1115, Lindavista, Ocotlán 47820, Jalisco, Mexico
Martha Patricia Gallegos-Arreola
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente, Centro Médico Nacional de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Sierra Mojada #800, Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Background: Breast cancer (BC) is the most common cancer among women worldwide, with incidence and mortality rates varying across ethnic groups due to sociodemographic, clinicopathological, and genomic differences. This study aimed to characterize the genomic landscape of BC in diverse ethnic groups using computational tools to explore these variations. Methodology: cBioPortal was used to analyze genomic, clinicopathological, and sociodemographic data from 1084 BC samples. Mutated genes were classified based on GeneCards platform data. Enrichment analysis was performed with CancerHallmarks, and genes not found were compared with MSigDB’s Hallmark Gene Sets. Genes absent from both were further analyzed using NDEx through Cytoscape.org to explore their role in cancer. Results: Significant differences (p Conclusions: This study identified significant clinicopathological and genomic variations in BC across ethnic groups. While key genes associated with cancer hallmarks were found, the incomplete characterization of some highlights the need for further research, especially focusing on ethnic groups, to understand their role in tumor biology and improve personalized treatments.
