Süleyman Demirel Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi (Nov 2019)

Aspirde Genetik İlişkilerin Peroksidaz Genleri Kullanılarak Belirlenmesi

  • Ayşe ÖZNUR ÇANKAYA,
  • Muhammet TONGUÇ,
  • Sercan ÖNDER

DOI
https://doi.org/10.29233/sdufeffd.612472
Journal volume & issue
Vol. 14, no. 2
pp. 367 – 373

Abstract

Read online

Aspir (Carthamus tinctorius L.) önemli bir yağ bitkisidir ve eski çağlardan beri Yakın Doğu’da kütürü yapılmaktadır. On beş peroksidaz gen markörü (POGP) 6 farklı ülkeye ait 39 aspir genotipinde (33 çeşit ve 6 ıslah hattı) genetik çeşitliliği araştırmak için kullanılmıştır. On dört POGP markörü aspirde polimorfizimler üretirken bir markör monomorfik olarak bulunmuştur. POGP markörleri aspirde toplam 71 band üretmiş ve üretilen bantlardan 50 tanesi polimorfik olarak bulunmuştur. Aspirde POGP markörü başına üretilen ortalama band sayısı 4.7 iken, ortalama polimorfik band sayısı 3.3 olmuştur. Aspirde genetik akrabalık ilişkilerini ortaya çıkarmak için benzerlik matrisi hesaplanmış ve UPGMA metodu ile dendrogram yapılmıştır. Aspir genotiplerinin benzerlik oranları 0.59-0.91 arasında değişim göstermiş ve ortalama benzerlik 0.80 olarak bulunmuştur ve genotipler 2 grup altında toplanmıştır. Markörlerin tespit ettiği gen çeşitliliği 0.17-0.48 arasında olmuştur. Mevcut sonuçlar, aspirde genetik çeşitliliği çalışmak için parmak izi yönteminde POGP markörlerinin kullanılabileceğini göstermektedir.Özet: Aspir (Carthamus tinctorius L.) önemli bir yağ bitkisidir ve eski çağlardan beri Yakın Doğu’da kütürü yapılmaktadır. On beş peroksidaz gen markörü (POGP) 6 farklı ülkeye ait 39 aspir genotipinde (33 çeşit ve 6 ıslah hattı) genetic çeşitliliği araştırmak için kullanılmıştır. On dört POGP markörü aspirde polimorfizimler üretirken bir markör monomorfik olarak bulunmuştur. POGP marörleri aspirde toplam 71 band üretmiş ve üretilen bantlardan 50 tanesi polimorfik olarak bulunmuştur. Aspirde POGP markörü başına üretilen ortalama band sayısı 4.7 iken, ortalama polimorfik band sayısı 3.3 olmuştur. Aspirde genetik akrabalık ilişkilerini ortaya çıkarmak için benzerlik matrisi hesaplanmış ve UPGMA metodu ile dendrogram yapılmıştır. Aspir genotiplerinin benzerlik oranları 0.59-0.91 arasında değişim göstermiş ve ortalama benzerlik 0.80 olarak bulunmuştur ve genotipler 2 grup altında toplanmıştır. Markörlerin tespit ettiği gen çeşitliliği 0.17-0.48 arasında olmuştur. Mevcut sonuçlar, aspirde genetik çeşitliliği çalışmak için parmak izi yönteminde POGP markörlerinin kullanılabileceğini göstermektedir.

Keywords