در این پژوهش، تنوع ژنتیکی قارچ های اندوفیت از جنس Neotyphodium در گندمیان Festuca arundinacea،F. pratensis وLolium prenne با استفاده از نشانگر های مولکولی AFLP مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور قارچ های اندوفیت از غلاف برگ گیاهان جدا و خالص سازی شدند. براساس خصوصیات مورفولوژیکی قارچ های اندوفیت جنس Neotyphodium انتخاب گردید. ترکیب آغازگری IS3/IS1 با قارچ های انتخابی، باند 444 جفت بازی که اختصاصی جنس Neotyphodium است را تکثیر نمود که موید شناسایی درست مورفولوژیک جنس قارچ های مورد نظر بود.