Evaluation of chronic diarrhea in patients newly diagnosed with HIV infection through the FilmArray® gastrointestinal panel

Abstract

Introduction: The treatment and diagnosis of chronic diarrhea in the immunocompromised patient depends on the ability to rapidly detect the etiologic agents. Aims: Our aim was to evaluate the results of the FilmArray® gastrointestinal panel in patients newly diagnosed with HIV infection that presented with chronic diarrhea. Material and methods: Utilizing nonprobability consecutive convenience sampling, 24 patients were included that underwent molecular testing for the simultaneous detection of 22 pathogens. Results: In 24 HIV-infected patients with chronic diarrhea, enteropathogen bacteria were detected in 69% of the cases, parasites in 18%, and viruses in 13%. Enteropathogenic Escherichia coli and enteroaggregative Escherichia coli were the main bacteria identified, Giardia lamblia was found in 25%, and norovirus was the most frequent viral agent. The median number of infectious agents per patient was three (range of 0 to 7). The biologic agents not identified through the FilmArray® method were tuberculosis and fungi. Conclusions: Several infectious agents were simultaneously detected through the FilmArray® gastrointestinal panel in patients with HIV infection and chronic diarrhea. Resumen: Introducción: El tratamiento y el pronóstico de la diarrea crónica en el paciente inmunosuprimido dependen de la capacidad para detectar rápidamente los agentes etiológicos. Objetivos: Evaluar los resultados del panel gastrointestinal (GI) FilmArray® en pacientes con diarrea crónica e infección por VIH de reciente diagnóstico. Material y métodos: Muestreo no probabilístico a conveniencia de manera secuencial. Se incluyeron 24 pacientes a quienes se realizó el estudio molecular para la detección simultánea de 22 patógenos. Resultados: En 24 pacientes infectados por el VIH con diarrea crónica se detectaron bacterias enteropatógenas en el 69% de los casos, parásitos en el 18% y virus en el 13%. Escherichia coli enteropatógena y Escherichia coli enteroagregativa fueron las principales bacterias identificadas; Norovirus fue el agente viral más frecuente encontrado (33%), seguido de Giardia lamblia (25%). La mediana del número de agentes infecciosos por paciente fue 3 (rango de 0 a 7). Los agentes biológicos no identificados por este método fueron tuberculosis y hongos. Conclusiones: Utilizando el panel GI FilmArray® se detectaron simultáneamente varios agentes infecciosos en pacientes con diarrea crónica e infección por VIH.

Keywords

• VIH/Sida
• Diarrea crónica
• Automated nested multiplex polymerase chain reaction system
• Diagnósticos