توالی یابی و بررسی بیوانفورماتیکی ایجاد توالی هدف ریز RNA های سرکوب‌ گر در UTR 3' ژن میوستاتین برخی گوسفندان بومی ایران

Abstract

میوستاتین، به‌عنوان عامل تنظیم‌کننده منفی رشد ماهیچه‌های اسکلتی در پستانداران شناخته‌شده است. ثابت‌شده است که برخی از جهش­های طبیعی موجود در ژن میوستاتین، به علت اثر منفی بر بیان این ژن باعث افزایش رشد و عضلانی شدن گونه­هایی مانند گاو، گوسفند، موش و سگ می‌شود. می­توان با استفاده از این الگوهای جهش و استفاده از مهندسی ژنتیک، حیوانات مزرعه­ای تراریخت با سرعت رشد بالاتر تولید کرد. در این تحقیق قسمتی از ناحیه 3' UTR ژن میوستاتین، به طول 2180 جفت باز در 15 رأس از نژادهای گوسفند دالاق، بلوچی و زل تعیین توالی شد. سپس توالی‌ها با هدف بررسی وجود جهش­ها و همچنین محل هدف ریز RNA ها بررسی و نسبت به ایجاد تغییر in silico در ناحیه تعیین توالی شده برای ایجاد توالی هدف ریز RNA های miR-1 و miR-206 که در سرکوب ژن میوستاتین و افزایش رشد بافت عضله نقش دارند اقدام شد. نتایج تعیین توالی نشان داد که کلیه گوسفندان این مطالعه فاقد جهشی مؤثر در تغییر بیان ژن میوستاتین بودند. با ایجاد تغییر in silico در دو جایگاه به‌صورت هدفمند، نسبت به ایجاد دو توالی هدف برای ریز RNA های miR-1 و miR-206 اقدام شد. بررسی بیوانفورماتیکی مشخص کرد که این جهش­ها دارای اثرات قابل پیش‌بینی جانبی نبودند و به همین علت، می­توان در آینده از این جهش­ها برای دستکاری ژنتیکی با روش ویرایش ژنوم و ایجاد فنوتیپ عضلانی در گوسفندان تراریخت بومی استفاده کرد.

Keywords

• بافت عضله
• گوسفند
• میوستاتین و ریز rna