Razvoj raziskovalnih metod za karakterizacijo združb arbuskularnih mikoriznih gliv in potencialni vpliv biodiverzitete glivnih endofitov na vegetacijo

Abstract

Karakterizacija in kvantifikacija funkcionalne in taksonomske raznolikosti mikrobnih združb je ključnega pomena za razumevanje vseh vidikov mikrobne ekologije in je povezana tudi širše z razumevanjem delovanja ekosistemov. Arbuskularna mikoriza predstavlja najbolj razširjeno in starodavno simbiozo na Zemlji, saj so arbuskularne mikorizne (AM) glive prisotne v koreninah več kot dveh tretjin vseh rastlinskih vrst. V dobrem desetletju od objave preglednega članka o uporabi molekulskih pristopov pri raziskavah arbuskularne mikorize v reviji Acta Agriculturae Slovenica (Maček, 2009) je razvoj metodologije, predvsem tehnologije določanja nukleotidnega zaporedja (sekvenciranja) naslednjih generacij (NGS), močno pospešil raziskave raznolikosti in ekologije združb AM gliv in drugih koreninskih endofitov. V tem članku so predstavljene novosti na področju raziskav endofitskih gliv v koreninah rastlin, s poudarkom na aktualnem pristopu k raziskavam v ekologiji in taksonomiji AM gliv, ter sistem njihove klasifikacije s tako imenovanimi virtualnimi taksoni (VT). Slednji je zelo uporaben za namen ekoloških raziskav in širše primerjave različnih študij med sabo. Na kratko je predstavljen tudi vpliv klimatskih in talnih lastnosti okolja na sestavo združb in pojavljanje posameznih taksonov AM gliv v različnih ekosistemih.