New Microbes and New Infections (Jan 2022)
First detection of SARS-CoV-2 variant B.1.1.529 (Omicron) in Ecuador
- A. Carrazco-Montalvo,
- I. Armendáriz-Castillo,
- C.L. Tello,
- D. Morales,
- R. Armas-Gonzalez,
- D. Guizado-Herrera,
- A. León-Sosa,
- D. Ramos-Sarmiento,
- B. Fuertes,
- L. Patino,
- P. Cárdenas,
- S. Márquez,
- B. Prado-Vivar,
- J.J. Guadalupe,
- B. Gutiérrez,
- M.B. Wong,
- M. Grunauer,
- G. Trueba,
- P. Rojas-Silva,
- V. Barragán
Affiliations
- A. Carrazco-Montalvo
- Dirección de Investigación, Desarrollo e Innovación, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- I. Armendáriz-Castillo
- Coordinación Zonal 9, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Quito, Ecuador
- C.L. Tello
- Dirección de Investigación, Desarrollo e Innovación, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- D. Morales
- Centro de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus Respiratorios, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- R. Armas-Gonzalez
- Centro de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus Respiratorios, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- D. Guizado-Herrera
- Dirección de Investigación, Desarrollo e Innovación, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- A. León-Sosa
- Dirección de Investigación, Desarrollo e Innovación, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- D. Ramos-Sarmiento
- Centro de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus Respiratorios, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- B. Fuertes
- Centro de Referencia Nacional de Influenza y Otros Virus Respiratorios, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador
- L. Patino
- Dirección de Investigación, Desarrollo e Innovación, Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública “Leopoldo Izquieta Pérez”, Guayaquil, Ecuador; Corresponding author: Leandro Patiño
- P. Cárdenas
- S. Márquez
- B. Prado-Vivar
- J.J. Guadalupe
- B. Gutiérrez
- M.B. Wong
- M. Grunauer
- G. Trueba
- P. Rojas-Silva
- V. Barragán
- Journal volume & issue
-
Vol. 45
p. 100951
Abstract
The National Institute of Research and Public Health reported the first local record of the Omicron variant detected in Ecuador. A fully vaccinated subject returned from South Africa with a negative RT-PCR. We present the cumulative frequency of the variants in Ecuador and a phylogenetic analysis of this new Omicron.