Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike

Abstract

Mramorirana šara pasa, nastala umetanjem kratkih ponovaca elemenata (SINE) u genetsku strukturu SILV gena, karakteriše se prisustvom slabije pigmentisanih polja pomešanih sa poljima normalne pigmentacije. Analizom SINE elementa lokalizovanog u SILV genu pasa sekvencioniranjem otkrila je varijabilnost poli(A) repa koji je odgovoran za različitu ekspresiju mramorirane šare. SINE element sa poli(A) repom dužine od 91 do 101 nukleotida je odgovoran za mramorirani fenotip sa svim karakterima mramorirane šare. Nasuprot tome, psi koji poseduju SINE element sa kratkim poli(A) repom dužine od 54 do 65 nukleotida su opisani kao prikriveni mramorirani bez ekspresije mramorirane šare. Cilj ove studije je poboljšanje metoda molekularne genetike za detekciju skrivenog alela za mramoriranu šaru pasa. Ukupno 40 pasa četiri rase: border koli, šetlandski ovčar, australijski ovčar i čivava bilo je uključeno u studiju. Genom DNK pasa bio je izolovan iz uzoraka pune krvi i ćelija sluznice usne duplje bio je izolovan pomoću komercijalnih kitova. Detekcija mramoriranog (M), prikriveno mramoriranog (Mc) i ne-mramoriranog (m) alela je izvršena pomoću „M13-tailed“ prajmera protokola i dve različite metode određivanja veličine alela za verifi kaciju rezultata elektroforeze. U analiziranoj populaciji pasa otkriveno je 20 pasa sa ne - mramoriranim genotipom mm, 17 pasa sa mramoriranim genotipom Mm, 2 psa sa duplim mramoriranim genotipom MM i jedan pas sa mramoriranim fenotipom, ali sa prisustvom prikrivenog mramoriranog alela Mc sa posledičnim genotiom MMC.

Keywords

• dog
• silv gene
• sine element
• merle pattern
• cryptic allele
• dna