ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf

Abstract

مقدمه: بیماری پوسیدگی نرم در گیاهان که توسط عوامل باکتریایی بیماری‌زا ایجاد می‌شوند، هرساله سبب کاهش محصولات تولیدی و همچنین خسارت به محصولات انباری می‌گردند. تحقیق حاضر به‌منظور ردیابی و شناسایی عوامل باکتریایی عامل پوسیدگی نرم متعلق به جنس سودوموناس در برخی از محصولات صیفی و گیاهان تزیینی انجام شد. مواد و روش‌ها: طی فصول زراعی در سال‌های 1394 تا 1396، نمونه‌های مشکوک و دارای علائم بیماری از میزبان‌های بادمجان، ذرت، برگ قاشقی، ذرت شیرین و گوجه‌فرنگی جمع‌آوری گردید. ویژگی‌های بیوشیمایی و موفولوژیکی جدایه‌ها بر اساس روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی بررسی شدند. همچنین ژن tuf در جدایه‌های نماینده با استفاده از آغازگرهای Bac-tuf-F و Bac-tuf-R به روش واکنش زنجیره‌ای پلی مراز تکثیر و پس از توالی یابی با بانک داده‌های موجود در سایت NCBI با نرم‌افزار بلاست تجزیه‌وتحلیل و مقایسه شدند. نتایج: درمجموع 120 جدایه باکتریایی از نمونه‌های موردنظر جداسازی گردید. بر اساس تولید آنزیم تجزیه‌کننده پکتین، پنج جدایه از جنس سودوموناس انتخاب شد. بر اساس نتایج آزمون‌های بیوشیمیایی و همچنین فیلوژنی بر پایه توالی یابی ژن tuf، این جدایه‌ها به‌عنوان گونه‌های Pseudomonas aeruginosa، P. entomophila، P. mosselii و P. putida شناسایی شدند. بحث و نتیجه‌گیری: بر اساس دانش ما، این اولین گزارش از بیماری‌زایی P. aeruginosa در گوجه‌فرنگی، P. entomophila در ذرت شیرین و P. putida در بادمجان است. علاوه بر این، برای اولین بار P. aeruginosa و P. mosselii به‌عنوان عامل همراه بیماری به ترتیب در ذرت و بادمجان گزارش می‌شود.

Keywords

• بادمجان
• ذرت
• برگ قاشقی
• ذرت شیرین
• گوجه فرنگی