Genomics Data (Jun 2015)
Draft genome sequence of the intestinal parasite Blastocystis subtype 4-isolate WR1
- Ivan Wawrzyniak,
- Damien Courtine,
- Marwan Osman,
- Christine Hubans-Pierlot,
- Amandine Cian,
- Céline Nourrisson,
- Magali Chabe,
- Philippe Poirier,
- Aldert Bart,
- Valérie Polonais,
- Pilar Delgado-Viscogliosi,
- Hicham El Alaoui,
- Abdel Belkorchia,
- Tom van Gool,
- Kevin S.W. Tan,
- Stéphanie Ferreira,
- Eric Viscogliosi,
- Frédéric Delbac
Affiliations
- Ivan Wawrzyniak
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Damien Courtine
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Marwan Osman
- Institut Pasteur de Lille, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, Inserm U1019, CNRS UMR 8204, Université Lille, Nord de France, France
- Christine Hubans-Pierlot
- Genoscreen Institut Pasteur, Lille, France
- Amandine Cian
- Institut Pasteur de Lille, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, Inserm U1019, CNRS UMR 8204, Université Lille, Nord de France, France
- Céline Nourrisson
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Magali Chabe
- Institut Pasteur de Lille, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, Inserm U1019, CNRS UMR 8204, Université Lille, Nord de France, France
- Philippe Poirier
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Aldert Bart
- Department of Medical Microbiology, Section Parasitology, Center for Infection and Immunity Amsterdam, Academic Medical Center, Amsterdam, The Netherlands
- Valérie Polonais
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Pilar Delgado-Viscogliosi
- Institut Pasteur de Lille, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, Inserm U1019, CNRS UMR 8204, Université Lille, Nord de France, France
- Hicham El Alaoui
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Abdel Belkorchia
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- Tom van Gool
- Department of Medical Microbiology, Section Parasitology, Center for Infection and Immunity Amsterdam, Academic Medical Center, Amsterdam, The Netherlands
- Kevin S.W. Tan
- Laboratory of Molecular and Cellular Parasitology, Department of Microbiology, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, Singapore
- Stéphanie Ferreira
- Genoscreen Institut Pasteur, Lille, France
- Eric Viscogliosi
- Institut Pasteur de Lille, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, Inserm U1019, CNRS UMR 8204, Université Lille, Nord de France, France
- Frédéric Delbac
- Clermont Université, Université Blaise Pascal-Université d'Auvergne-CNRS, UMR 6023 Laboratoire Microorganismes: Génome et Environnement, Clermont-Ferrand, France
- DOI
- https://doi.org/10.1016/j.gdata.2015.01.009
- Journal volume & issue
-
Vol. 4,
no. C
pp. 22 – 23
Abstract
The intestinal protistan parasite Blastocystis is characterized by an extensive genetic variability with 17 subtypes (ST1–ST17) described to date. Only the whole genome of a human ST7 isolate was previously sequenced. Here we report the draft genome sequence of Blastocystis ST4-WR1 isolated from a laboratory rodent at Singapore.
Keywords
- Blastocystis subtype 4-isolate WR1
- Illumina-HiSeq
- Whole genome
- Annotation using Maker gene annotation pipeline
