Revista Ciência Agronômica (Jun 2013)
Genetic variation in oriental tobacco (Nicotiana tabacum L.) by agro-morphological traits and simple sequence repeat markers Variação genética em tabaco oriental (Nicotiana tabacum L.) por marcadores agro-morfológicos e traços simples de repetição de sequência
Abstract
The objectives of this study were to assess genetic diversity and determine differences between several oriental tobacco genotypes by examining both agro-morphological traits and molecular markers. Simple lattice design with two replications was used to evaluate 100 oriental tobacco genotypes. Analysis of variance manifested that there is high level of genetic diversity in oriental-type tobaccos based on morphological traits including number of leaf, days to 50% flowering, leaf length, leaf width, leaf fresh weight, leaf dry weight, stem height and stem girth. Classification of genotypes using agro-morphological data by means of un-weighted pair-group method using arithmetic average (UPGMA) algorithm based on squared standardized Euclidean distances resulted four distinguishable groups that pursuit own geographical distribution. In the molecular marker investigations, a total of 13 simple sequence repeats (SSR) primer pairs were used to determine polymorphism of the test germplasm. Thirty five alleles were scored at 13 SSR loci. The average number of alleles per locus (na) and the effective allele number (Ae) were 2.69 and 2.34, respectively. By using SSR data, pair wise Jaccard's similarity coefficients were produced. Grouping of genotypes via Jaccard's similarity coefficients and using UPGMA clustering method lead to three groups that had not any accommodated with own origins. Results reveled that there is not completely agreement for classification based on agro-morphological and SSR loci in oriental-type tobaccos. Because of non influence of environmental effects on molecular marker, heterotic groups based on SSR markers could be closer to reality.Os objetivos deste estudo foram avaliar a diversidade genética e determinar as diferenças entre diversos genótipos de tabaco oriental através tratos morfológicos e marcadores moleculares. O delineamento utilizado foi o látice simples com duas repetições e foram avaliados 100 genótipos de tabaco simples. As análises de variância mostarram que há pouca alto nível de diversidade genética nos tabacos to tipo oriental baseado nos tratamentos morfológicos incluindo número de folhas, dias para os 50% do florescimento, comprimento da folha, largura da folha, peso fresco da folha, peso seco da folha e maior comprimento e espessura do caule. A classificação dos genótipos usando o método de dados morfológicos por médias de grupos pareados não ponderados usando média aritmética (UPGMA) algoritmo baseado nas distâncias Euclidianas quadradas padronizadas resultou quatro grupos distintos de acordo co a própria distribuição geográfica. Nas investigações dos marcadores moleculares, um total de 13 repetições de sequências simples (RSS) de iniciadores pares foram utilizados para determinar o polimorfismo do germoplasma de teste. Trinta e cinco alelos foram marcados em 13 locos RSS. O numero médio de alelos por loco (na) e o número de alelo efetivo (Ae) forma 2,69 e 2,34, respectivamente. Utilizando os dados RSS, coeficientes de similaridade de Jaccard foram produzidos. O agrupamento de genótipos através dos coeficientes de similaridade de Jaccard e usando o método de agrupamento UPGMA que considera três grupos que não tiveram algum alojamento com suas próprias origens. Os resultados revelaram que revelaram que não estão completamente de acordo para classificação baseada em agro-morfológicas por loco e RSS em tabacos do tipo oriental. Por causa da não influencia dos efeitos ambientais no marcador molecular, grupos heteróticos com base em marcadores SSR poderiam estar mais próximos da realidade.
