电子束注入器是决定自由电子激光太赫兹源（Free Electron Laser for Terahertz，FEL-THz）性能的核心部件，基于射频加速器的注入器能够产生驱动高功率THz辐射所需的高品质电子束。同时，出于商业化和市场化的考虑，注入器还需具备结构紧凑的特点。采用独立调谐式结构（Independently Tunable Cavity，ITC）的束流注入器具有平衡高品质、低成本以及紧凑性的优势，在大功率FEL-THz装置小型化方面有广阔的应用前景。然而，随着束线长度的缩短和装置整体规模的压缩，注入器在运行过程中面临着在线调节手段和诊断能力不足等挑战。本文依托华中科技大学与中国科学技术大学共建的一台紧凑型FEL-THz注入器，首先介绍其基于ITC结构的优化思路和设计结果，然后在系统稳定的基础上，重点阐述调试和运行过程中所涉及的束流间接诊断和系统优化措施，并结合束流动力学仿真和在线实验开展了相关方案和研究的验证。仿真和实验结果均表明，通过优化设计并结合间接诊断技术，ITC注入器能够兼顾FEL-THz高功率和小型化的需求，而间接诊断技术的应用也能够弥补调试过程中诊断手段不足的问题，为ITC注入器的进一步推广奠定了基础。
