Semina: Ciências Agrárias (Dec 2012)
Identification of Discolobium species indigenous to the Brazilian Pantanal ecosystem by microsatellite (SSRs) markers <br>Identificação de espécies de Discolobium do Pantanal de Mato Grosso pelo uso de marcadores microssatélites (SSRs)
Abstract
The genus Discolobium comprises forage legumes indigenous to the Brazilian Pantanal. Over 80% of the Pantanal areas flood during the wet season, and stem and root nodules showing high biological N2 fixation rates result in high protein content in Discolobium plants, representing a major component of the animals’ diet in this area. In nature it is possible to recognize Discolobium species based on some phenotypic properties, as the size, shape and viscosity of the leaflets and fruit morphology. However, when cropped under controlled environmental conditions such characteristics do not express, making species discrimination difficult. In this study, the DNA of four Discolobium species – D. pulchellum, D. psoraleaefolium, D. leptophyllum and Discolobium sp. (non-identified species) – were amplified by PCR with eight microsatellites primers (SSRs, Simple Sequence Repeats), previously identified as effective for discriminating soybean genotypes. One of those primers, Satt 251, detected polymorphism between the Discolobium species, allowing their correct identification under any environmental condition. The use of molecular markers in studies with ecological and economical importance, but poorly studied tropical legume species, such as Discolobium spp., may considerably improve their usage and preservation.O gênero Discolobium compreende leguminosas forrageiras nativas do Pantanal brasileiro, a maior área de terras naturalmente inundadas do mundo. Quase 80% das áreas do Pantanal são submetidas a alagamento durante a estação das chuvas, e nódulos no caule e nas raízes de Discolobium com altas taxas de fixação biológica do N2 resultam em teores elevados de proteína, representando um componente importante da dieta animal. Na natureza é possível reconhecer plantas de Discolobium por alguns sinais fenotípicos, como o tamanho, forma e pegajosidade dos folíolos e a morfologia dos frutos. Contudo, quando cultivadas em ambiente controlado, tais características não se expressam, dificultando a diferenciação entre as espécies. Neste estudo, o DNA de quatro espécies de Discolobium – D. pulchellum, D. psoraleaefolium, D. leptophyllume Discolobium sp. (espécie não identificada) – foi amplificado pela reação de PCR (Polymerase Chain Reaction) com oito primers do tipo microssatélite (SSRs, Simple Sequence Repeats), previamente identificados como efetivos para a diferenciação de cultivares de soja. Um desses primers, o Satt 251, detectou polimorfismo entre as espécies estudadas, permitindo a identificação correta das mesmas sob quaisquer condições ambientais. O emprego de marcadores moleculares em estudos com leguminosas tropicais de importância ecológica e ambiental, mas ainda pouco estudadas, como Discolobium spp., pode contribuir consideravelmente para o uso e preservação dessas espécies.
