AIA Avances en Investigación Agropecuaria (Jun 2024)
Digestión in silico para identificar especies de Xyleborus (Curculionidae: Scolytinae) de importancia agrícola
Abstract
Introducción. El género Xyleborus contiene especies de hábitos ambrosiales que se consideran plagas potenciales de gran impacto económico, debido a que afectan a una amplia variedad de plantaciones naturales y agrícolas del país. En México, el género Xyleborus está representado por hasta 18 especies, cuya identificación se basa principalmente en caracteres morfológicos, lo que dificulta las actividades de control dentro de su área de distribución (Pérez-De La Cruz et al., 2009). Xyleborus glabratus es una especie que representa un peligro potencial pues se le asocia el hongo Raffaelea lauricola que causa una enfermedad mortal en plantas de la familia Lauraceae (incluyendo el aguacate); en México, se mantiene como especie cuarentenaria, sin embargo, se reportó en el sur de EE UU afectando cultivos de aguacate y causando enormes pérdidas económicas (Castrejón-Antonio et al., 2017). Objetivo. Probar la digestión in silico (virtual) como una nueva herramienta para identificar a las diferentes especies Xyleborus presentes en el país. Métodos. Se utilizaron secuencias de barcoding de especies de Xyleborus disponibles en bases de datos en línea fueron descargadas, dichas secuencias se utilizaron para realizar su digestión in silico con 62 enzimas en el servidor NEBcutter (Vincze-Tamas et al., 2003) y se identificaron a las especies mediante los diferentes tamaños de bandas generados por la actividad enzimática. Resultados y discusión. La digestión enzimática generó diferentes tamaños de bandas que poseen variación suficiente como para diferenciar entre las diferentes especies de Xyleborus ya presentes en el país, incluyendo X. glabratus. Dos enzimas permitieron discriminar entre las especies ya presentes en México y X. glabratus, mientras que seis permitieron discriminar solamente entre las diferentes especies previamente reportadas en México. Conclusión. La digestión enzimática tiene potencial como herramienta de apoyo para distinguir especies que forman complejos crípticos cuya identificación morfológica es compleja, sin la necesidad de recurrir a la secuenciación completa de fragmentos de ADN que supone mayor costo y tiempo.
Keywords
