Pathogens (Jan 2025)
First Detection of <i>Alphacoronavirus</i> in Bats from the World’s Largest Wetland, the Pantanal, Brazil
- Tayane B. S. Magalhães,
- Amanda de O. Viana,
- Thiago B. F. Semedo,
- Juliane S. Saldanha,
- Nicole A. dos Reis,
- Nathalia de A. Pereira,
- Rachel V. P. de Barros,
- Hannah R. Miranda,
- Gabriella C. Almeida,
- Desyrée Y. S. R. Ozaki,
- Giovana S. Caleiro,
- Gustavo O. Fenner,
- Fernanda P. Vizu,
- Theo Kraiser,
- Thais P. Carvalho,
- Luciano M. Thomazelli,
- Erick G. Dorlass,
- Clarice W. Arns,
- Helena L. Ferreira,
- Erika Hingst-Zaher,
- Rogério Vieira Rossi,
- Guilherme S. T. Garbino,
- Edison L. Durigon,
- Jansen de Araujo,
- Daniel M. de Aguiar
Affiliations
- Tayane B. S. Magalhães
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Amanda de O. Viana
- Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Thiago B. F. Semedo
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Juliane S. Saldanha
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Nicole A. dos Reis
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Nathalia de A. Pereira
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Rachel V. P. de Barros
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Hannah R. Miranda
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Gabriella C. Almeida
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Desyrée Y. S. R. Ozaki
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Giovana S. Caleiro
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Gustavo O. Fenner
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Fernanda P. Vizu
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Theo Kraiser
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Thais P. Carvalho
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Luciano M. Thomazelli
- Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Erick G. Dorlass
- Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Clarice W. Arns
- Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual de Campinas, Campinas 13083-862, Brazil
- Helena L. Ferreira
- Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil
- Erika Hingst-Zaher
- Museu Biológico, Instituto Butantan, São Paulo 05585-000, Brazil
- Rogério Vieira Rossi
- Laboratorio de Mastozoologia, Instituto de Biociencias, Universidade Federal de Mato Grosso, Cuiabá 78060-900, Brazil
- Guilherme S. T. Garbino
- Museu de Zoologia João Moojen, Departamento de Biologia Animal, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa 36570-900, Brazil
- Edison L. Durigon
- Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Jansen de Araujo
- Laboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil
- Daniel M. de Aguiar
- Laboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil
- DOI
- https://doi.org/10.3390/pathogens14010058
- Journal volume & issue
-
Vol. 14,
no. 1
p. 58
Abstract
Coronaviruses (CoV) infect a wide variety of hosts, causing epidemics in humans, birds, and mammals over the years. Bats (order Chiroptera) are one of the natural hosts of the Coronaviridae family. They represent 40% of the total number of mammal species in the Pantanal, a biodiversity hotspot in South America. Given the recent SARS-CoV-2 pandemic, we investigated the presence of CoV in bats captured in the Brazilian Pantanal. Oral and rectal swabs collected in 2021 from 419 bats were analyzed using Pancoronavirus-nested PCR targeting the RNA-dependent RNA-polymerase (RdRp) gene. Orthocoronavirinae was detected in 16.7% (70/419) of the bats; nine samples were sequenced, confirming that Carollia perspicillata (4), Phyllostomus hastatus (2), Desmodus rotundus (1), Molossus rufus (1), and Myotis cf. nigricans (1) collected in buildings formally used by humans were infected by Alphacoronavirus genera. This is the first description of Alphacoronavirus in bats from the Pantanal. As they are natural reservoirs of CoVs, constant monitoring of bats is important to comprehend the epidemiology of emerging viruses, especially in the Pantanal biome.
Keywords
