رستنی‌ها (Dec 2018)
نخستین گزارش از گونه Neocosmospora vasinfecta جداسازی شده از خاک‌های بکر در ایران
Abstract
در تابستان سال 1396، طی یک بررسی به منظور شناسایی گونه‌های قارچی از خاک‌های بکر استان کرمانشاه، نمونه‌های خاک از عمق 20-0 سانتی‌متری جمع‌آوری و از خاک جداسازی و سپس با روش تهیه رقت با استفاده از محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار صورت گرفت. در این بررسی، یک جدایه از خاک بکر (دامنه کوه) سومار واقع در منطقه قصر شیرین به دست آمد. میسلیوم در این جدایه به رنگ سفید مایل به کرم بود (شکل 1A). پریتسیوم نارنجی رنگ تا قرمز تیره، کروی تا گلابی شکل با گردن کوتاه، روزنه‌دار، دارای پریفیز و به ابعاد 240 تا 350 میکرومتر بود (شکل 1B). آسک‌ها سیلندری، دارای هشت آسکوسپور، دیواره نازک، غیرآمیلوییدی، با انتهای صاف و پدیسل کوتاه و به ابعاد 12–10 × 100–80 میکرومتر بود (شکل 1C). آسکوسپورها یک جداره، دارای دیواره مضرس، کروی تا بیضوی، شفاف و در زمان بلوغ قهوه‌ای و گاهی اوقات دارای قطره روغن و به ابعاد 63/9 × 23/11 میکرومتر بود (شکل 1D).براساس خصوصیات مورفولوژیکی، این جدایه Neocosmospora شناسایی شد.برای شناسایی گونه، اسخراج دی.ان.ای. به روش سی تب صورت گرفت و نواحی نسخه‌برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته (ITS) و قسمتی از فاکتور طویل‌کننده ترجمه (TEF1) با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و جفت آغازگرهای ITS1/ITS4 و EF1F/EF1R تکثیر شدند. آنالیز فیلوژتیکی به روش بیشینه درست‌نمایی (Maximum likelihood) و با استفاده از نسخه 5 نرم‌افزار مگا صورت گرفت. در توالی‌یابی ناحیه نسخه‌برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته و قسمتی از فاکتور طویل‌کننده ترجمه برای این جدایهتعداد 550 و 650 جفت باز به ترتیب به دست آمد که ناحیه نسخه‌برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته 99 درصد با گونه Neocosmosporavasinfecta با شماره دسترسی KM231804 از کشور هند و فاکتور طویل‌کننده ترجمه 100 درصد با گونه‌ای به همین نام با شماره دسترسی JX997934 از فرانسه شباهت داشت. این جدایه با شماره دسترسی MG811579 برای ناحیه نسخه‌برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته و با شماره دسترسی MH976665 برای فاکتور طویل‌کننده ترجمه در پایگاه اطلاعاتی بانک ژن ثبت گردید.آنالیز فیلوژنتیکی ناحیه نسخه‌برداری شده داخلی دی.ان.ای. ریبوزومی هسته با بیشینه درست‌نمایی صحت شناسایی گونه را تایید کرد و نمونه ما با ضریب اطمینان بالا همراه با نمونه‌های معتبر از کشورهای دیگر در یک گروه قرار گرفت (شکل 2). جدایه قارچ فوق در مجموعه قارچ‌های زنده وزارت جهاد کشاورزی در مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور (تهران) نگهداری می‌شود. این گونه برای فلور قارچی ایران برای نخستین بار از ایران گزارش می‌شود. نمونه بررسی شده: استان کرمانشاه، قصر شیرین، سومار، 45° 95΄ E, 33° 96΄ N، 5/4/1396، جداسازی شده از خاک بکر، شیما سعیدی (IRAN 3320 C).
Keywords
