Journal of Bioinformatics and Genomics (Nov 2023)

ВЛИЯНИЕ МУТАЦИИ SDHB: P.M103V НА СТРУКТУРУ И ДИНАМИКУ БЕЛКА

  • Калинин Д.В.,
  • Аюпова А.Ф.,
  • Елизарова Е.Т.,
  • Павлов В.С.,
  • Головюк А.Л.,
  • Снежкина А.В.,
  • Кудрявцева А.В.

DOI
https://doi.org/10.18454/jbg.2023.22.1
Journal volume & issue
Vol. 22, no. 4

Abstract

Read online

Параганглиомы головы и шеи – это редкие нейроэндокринные опухоли, характеризующиеся высокой степенью наследуемости (около 40%) и часто ассоциированные с мутациями в генах SDHx. Вагальная параганглиома (ВПГ) развивается из параганглия, располагающегося вдоль блуждающего нерва, и встречается в 13% случаев параганглиом головы и шеи. Среди всех параганглиом/феохромоцитом, ВПГ является наиболее агрессивной опухолью и чаще всего метастазирует, при этом из-за редкости заболевания, генетика ВПГ мало изучена. Ранее мы идентифицировали миссенс вариант p.M103V в гене SDHB с неопределенной клинической значимостью в исследуемой выборке из 36 ВПГ. В данной работе выполнен анализ влияния выявленной мутации SDHB: p.M103V на структуру и динамику белка с использованием метода моделирования молекулярной динамики. Показано, что эта мутация вызывает серьезные структурные изменения и может привести к нарушению стабильности белка и его функции. Таким образом, негативный эффект варианта p.M103V на структуру/функцию субъединицы SDHB, а также ассоциация с параганглиомами/феохромоцитомами и другими опухолевыми синдромами, свидетельствуют о ее вероятной патогенности.

Keywords