Медицинская иммунология (Aug 2019)
Корреляционный анализ экспрессии генов мультифункционального белка YB-1, цитокинов воспаления и белка лекарственной устойчивости P-gp в операционном материале больных туберкулёзом лёгких.
Abstract
Актуальность: YB-1 - мультифункциональный белок, фактор транскрипции, участвующий в регуляции многочисленных клеточных процессов. YB-1 является важным участником молекулярных каскадов, через которые регулируются реакции организма на присутствие возбудителя, активность воспаления, эффективность заживления и излечения. Эти функции YB-1 являются актуальными и при таком социально-значимом заболевании, как туберкулёз лёгких, при котором выявление транскрипционной активности YBX1 и роли YB1 в патогенезе ранее не проводилось. В связи с этим, была поставлена цель исследования: определить у больных туберкулёзом лёгких (туберкулёмами) наиболее значимые корреляции между экспрессией гена белка YB-1, генами ключевых цитокинов, участвующих в регуляции воспаления при ТБ (IL-6, IL-10, INF-γ, TGF-β, TNF-α, IL-1β), фактором гипоксии HIF1a и геном белка P-gp ABCB1. Методы: уровни экспрессии генов определяли с помощью количественной ПЦР в образцах перифокальной области гранулем, полученных от 35 пациентов в ходе плановой операции. На основе результатов ПЦР был проведен корреляционный и иерархический кластерный анализ. Статистическую обработку проводили с помощью статистического пакета GraphPad Prism Version 7.04. Корреляцию между переменными оценивали с помощью коэффициента корреляции Спирмена. Иерархический кластерный анализ и тепловые карты выполняли с использованием инструмента ClustVis 2.0. Результаты: обнаружена положительная корреляция между экспрессией генов YBX1, TGFB1 и ABCB1. Корреляция между экспрессией генов YBX1 и ABCB1 умеренная, при этом экспрессия гена ABCB1 имеет сильную положительную корреляцию с генами HIF1A и IL6. Наиболее сильная корреляция выявлена между YBX1 и TGFB1 (r=0,62). Корреляция YBX1 с генами других цитокинов отсутствует. При этом TGFB1 имеет умеренную корреляцию с TNF (r=0,56). Взаимосвязь YBX1 с TGFB1 также подтвердил иерархический кластерный анализ, который демонстрирует формирование единого кластера генов YBX1, TGFB1, TNF. Обсуждение и заключение: мы предполагаем, что выявленный в нашей работе кластер генов YBX1, TGFB1, TNF образует регуляторную систему, играющую важную роль в развитии туберкулезного воспаления. Наша работа расширяет данные о молекулярно-генетической характеристике одной из форм туберкулёзом лёгких – туберкулёмах. Мы предполагаем, что белок YB-1 потенциально может выполнять при туберкулёзом лёгких разные функции: выступать в качестве одного из участников туберкулёзного воспаления через влияние на экспрессию генов ключевых цитокинов, а также модулировать активность белка-транспортёра P-gp и изменять фармакокинетику противотуберкулёзных препаратов, что требует дальнейшего изучения.
