Procesamiento de lenguaje natural para texto clínico en español: el caso de las listas de espera en Chile

Abstract

Resumen: Las listas de espera no cubiertas por el Plan de Garantías Explícitas en Salud para nueva consulta de especialidad en Chile se han visto incrementadas por los efectos de la pandemia del coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19). Esto representa un problema debido a la demora en la resolución y priorización de cada caso de derivación al nivel secundario de atención en salud. El objetivo de este artículo es exponer el problema de la lista de espera en el sistema de salud de Chile, y abordarlo como ejemplo de la aplicación de técnicas de Procesamiento del Lenguaje Natural (PLN). Específicamente, se describe una metodología para el reconocimiento de información clave en narrativas médicas. Actualmente, contamos con un conjunto de interconsultas médicas manualmente anotadas en el desarrollo del Corpus de Lista de Espera Chilena, y con una fracción de 2.000 interconsultas en las que las entidades médicas anotadas fueron normalizadas de forma automatizada a los conceptos del Sistema de Lenguaje Médico Unificado empleando el léxico MedLexSp. Este y otros recursos lingüísticos y herramientas de PLN están siendo desarrollados por el grupo de PLN en Medicina del Centro de Modelamiento Matemático de la Universidad de Chile y otros grupos a nivel nacional, los cuales constituyen aportes relevantes que pueden ser transferidos al sistema de salud chileno, con el objetivo de apoyar la gestión del texto clínico en español. Abstract: The waiting lists not covered by the Explicit Health Guarantee Plan for new specialty consultation in Chile increased due to the effects of the SARS-CoV-2 coronavirus (COVID-19) pandemic. This represents a problem derived from the delay in the resolution and prioritization of each case. This paper aims to describe the issue of the waiting lists in the Chilean health system and present an example of the application of Natural Language Processing (NLP). Specifically, a methodology for recognizing key information in medical narratives is described. Currently, we have a set of manually annotated medical referrals in the development of the Chilean Waiting List Corpus, with a fraction of 2,000 referrals in which the annotated medical entities were automatically normalized to the Unified Medical Language System concepts using the lexicon MedLexSp. The clinical NLP Group of the Center for Mathematical Modeling of the University of Chile, and other national NLP groups, are developing several tools and resources in medicine that can be transferred to the Chilean health system to support managing clinical text in Spanish.

Keywords

• Natural Language Processing
• Medical Informatics
• Artificial Intelligence
• Waiting Lists