Genetska raznolikost bakterij v črevesu enakonožnih rakov (Isopoda, Crustacea)

Abstract

V predelu zadnjega črevesa enakonožnih rakov vrste Porcellio scaber smo z vrstično elektronsko mikroskopijo odkrili paličaste bakterije, ki se s konci pritrjajo na kutikularne izrastke črevesne stene. Pritrjene bakterije so lahko del avtohtone črevesne mikroflore enakonožnih rakov, katere obstoj še ni bil potrjen. Ker opisanih bakterij ni mogoče gojiti s klasičnimi gojitvenimi tehnikami, smo iz spranih čreves petih zdravih odraslih rakov izolirali skupno DNK, iz katere smo s PCR namnožili bakterijske gene za 16S rRNK. Te gene smo vključili v plazmidni vektor in jih transformirali v kompetentne celice E.coli. Iz klonov izolirano plazmidno DNK smo razkrojili z restrikcijskima encimoma DdeI in TaqI in na podlagi restrikcijskih profilov z metodo UPGMA naredili fenogram. 37 preiskanih genov za 16S rRNK lahko na podlagi restrikcijskih profilov razdelimo v vsaj tri večje skupine, kar kaže, da se na kutikularne trne v črevesu P.scaber morda pritrjuje več različnih bakterijskih vrst.

Keywords

• enakonožni raki
• črevo
• mikrobiologija
• bakterije
• genetska raznolikost
• 16S rDNK