همسانه‌سازی و بررسی ویژگی‌های آنتی‌ژن Omp31 باکتری بروسلا ملیتنسیس

Abstract

بروسلوز یک بیماری عفونی کاملا شناخته شده و شایع در میان حیوانات اهلی می­باشد. به علت ایجاد مشکلات جدی کلینیکی و اقتصادی این بیماری، راهکارهای گوناگونی برای جلوگیری از ایجاد عفونت­های ناشی از آن، با استفاده ازتولید واکسن­های نوترکیب براساس آنتی ژن­های پروتئینی خارج غشایی بروسلا، ایجاد شده است. هدف از این مطالعه، کلون سازی، بررسی توالی و پیش بینی اپی­‌توپ­های ژن Omp31 باکتری بروسلا گونه ملیتنسیس به عنوان آنتی ژن موثر بود. بر این اساس، ناحیه خوانش (ORF) مربوط به این ژن­ها توسط پرایمرهای اختصاصی تکثیرو در داخل وکتور pTZ57R/T کلون شدند. همچنین توالی این ژن ها در NCBI ثبت شدند. نتایج آنالیزهای فیلوژنی نشان داد که این دو ژن در میان گونه­های مختلف بروسلا تقریبا بطور کامل مشابه اند. همچنین از نرم افزارهای اینترنتی برای پیش بینی اپی‌­توپ­های مرتبط با سلول­های B وT، ساختارهای دوم و سوم، خاصیت ایجاد تحریک سیستم ایمنی و نواحی که تحت تاثیر آنزیم­ها هستند استفاده شده است. ابزارهای بیوانفورماتیکی مورد استفاده در این مطالعه توسط پیش بینی سه اپی­‌توپ مختلف به روش تجربی، تایید شدند. آنالیزهای بیوانفورماتیکی سه اپی­توپ مربوط به سلولB و یک اپی توپ مربوط به سلول T را برای آنتی ژن Omp31 نشان دادند. در آخر بر اساس توانایی تحریک سیستم ایمنی و جایگاه تشخیص پروتـئوزومی، اپی‌­توپ­های مربوط به سلولT وB برای (Omp31 اسیدهای آمینه 191- 204) پیش بینی شد. آنالیزهای بیوانفورماتیکی نشان داد که این نواحی خواص کامل اپی­توپی را دارا می­باشند بنابر این می­توانند برای توسعه واکسن نوترکیب مفید واقع شوند.

Keywords

• بروسلا ملیتنسیس
• Omp3
• تحلیل انفورماتیک زیستی