تعیین تیپ مولکولی کلستریدیوم پرفرینجنز جدا شده از گوسفند و بز در ایران

Abstract

در این مطالعه یک روش مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیر‌ه‌ای پلیمراز برای تایپینگ کلستریدیوم پرفرینجنز راه اندازی شده و سپس نسبت به تعیین تیپ64 نمونه کلستریدیوم پرفرینجنز جدا شده از گوسفند و بزدر ایران اقدام گردید . با استفاده از روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ژن‌های آلفا، بتا و اپسیلون تکثیر یافته و ژنوتیپ های A، B، C و D مورد شناسایی قرار گرفتند. تعداد 9 عدد (07/14%) از جدایه های آزمایش شده در ژنوتیپ های A ، 20 نمونه (25/31%) در ژنوتیپ B ، 17 نمونه (5/26%) در ژنوتیپ C و 18 نمونه (1/28%) در ژنوتیپ D قرار گرفتند. قطعات مرتبط با هریک از توکسین های آلفا ، بتا و اپسیلون با یک جفت پرایمر اختصاصی که ابتدا روی سویه های رفرانس ( واکسینال ) آزمایش گردید تکثیر داده شدند . در سیستم واکنش زنجیره‌ای پلیمراز استفاده شده در این مطالعه قطعه مرتبط با ژن توکسین های آلفا ، بتا و اپسیلون به ترتیب 900 ، 611 و 402 جفت باز طول داشتند. هویت قطعات محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ژن‌های آلفا ، بتا و اپسیلون به روش سیکونسینگ و مقایسه آنها در بانک ژن تاًیید گردید. نتایج حاصل از Alignment نشان دهنده تشابه بالای 98% بین توالی حاصل از سویه‌های رفرانس این مطالعه با توالی های موجود در بانک ژن می باشد. نتایج این تحقیق نشان داد که ژنوتایپینگ به روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تایپینگ کلستریدیوم پرفرینجنز ابزار آزمایشگاهی مناسبی می‌باشد.

Keywords

• کلستریدیوم پرفرینجنز
• تایپینگ
• توکسین
• واکنش زنجیره‌ای پلیمراز