مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار (Jan 1970)
تأثیر دما بر ساختار فاکتور رشد شبه‌انسولینی (IGF-1) و مطالعه‌ای مبتنی بر شبیه‌سازی با روش‌های دینامیک مولکولی و محاسبات کامپیوتری
Abstract
زمینه و هدف: فاکتور رشد شبه‌انسولینی به‌طور طبیعی در سیستم عصبی مرکزی (CNS) موجود است و نقش مهمی در تکثیر و تمایز سلولی در طی رشد و بلوغ مغز دارد. این فاکتورها به‌همراه پروتئین‌های پیوند به آن‌ها و گیرنده‌هایشان در نواحی آسیب دیده‌ی مغز بیان می‌شوند که نقش سیستم IGF ها را در آسیب مغزی نشان می‌دهد. شبیه‌سازی مولکولی یک روش محاسباتی مستقیم برای مطالعه‌ی تغییرات ساختمانی طیف وسیعی از مسایل فیزیکی و بیولوژیکی می‌باشد. از نظر محاسباتی، میدان‌های نیروی تجربی اشکال زیادی در شبیه‌سازی تا خوردن فاکتور رشد شبه‌انسولینی دارند. مواد و روش‌ها: در این مطالعه درجه حرارت انتقال برای IGF-1 مدل شد. سیستم به تعادل رسید و در مدت 100 پیکوثانیه برای تحلیل با روش مولکولار دینامیک مطالعه شد. یافته‌ها: بررسی تغییرات انرژی پتانسیل در سه میدان نیرو مشخص نمود، میدان نیروی AMBER از میدان نیروی MM+ و OPLS بهتر می‌باشد و نیز شبیه‌سازی MD حداقل در این مدل از روش‌های MC و LD اثرپذیری بیشتری دارد. نتیجه‌گیری: درجه حرارت‌های پایین باعث پایداری ساختار می شود، در صورتی‌که درجه حرارت‌های بالا حالت عکس دارد.
