ردیابی و بررسی جایگاه تبارزایی ویروس پنهان زعفران Saffron latent virus در مزارع زعفران استان‌های خراسان جنوبی و رضوی

Abstract

ویروس پنهان زعفران (Saffron Latent Virus, SaLV)، یک گونه جدید از جنس Potyvirus است که به تازگی در ایران شناسایی شده است. علی‌رغم اینکه بسیاری از علایم این ویروس مخفی می‌باشد، اما خسارت آن در مزارع زعفران قابل ملاحظه است. علیرغم شناسایی این ویروس، تاکنون بررسی تبارزایی جدایه ­های آن بر مبنای پروتئین پوششی صورت نگرفته است. برای بررسی این ویروس تعداد 152 نمونه از برگ، گل و بنه زعفران‌های بدون علایم و دارای علایم کوتولگی، زردی و پیچیدگی از مزارع استان‌های خراسان جنوبی و رضوی، جمع‌آوری گردید. پس از استخراج RNA ، با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلی­مراز معکوس (RT-PCR) و آغازگرهای اختصاصی مربوط به پروتئین پوششی، حضور SaLV مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد تعداد 92 نمونه از 152 نمونه (معادل 60%) آلوده به ویروس بودند. در نهایت هفت نمونه به عنوان نمونه­ هایی که برمبنای شهرستان محل نمونه­ برداری از 92 نمونه تکثیر شده در آزمون زنجیره­ای پلی­مراز، انتخاب شده بودند مورد توالی­ یابی قرار گرفتند. بررسی­ های تبارزایی، بر پایه پروتئین پوششی و با نرم افزار MEGAX، نشان داد که جدایه ­های این ویروس دو گروه مجزا تشکیل دادند، که جدایه‌های مورد مطالعه در این تحقیق در گروه دوم قرار گرفتند. از آنجائیکه جدایه‌های مربوط به یک منطقه و یک محصول در گروه های مختلف پخش شده، بنابراین منطقه جغرافیایی جداسازی و نوع میزبان در تبارزایی ویروس تاثیر گذار نمی ­باشد. تحقیق حاضر برای اولین بار به ردیابی ویروس از روی گل و بنه زعفران و نیز بررسی تبارزایی جدایه­ های این ویروس جدید بر مبنای پروتئین پوششی در ایران می ­پردازد.

Keywords

• آغازگر اختصاصی
• پروتئین پوششی
• تبارزایی
• تعیین توالی