Nature Communications (Jan 2025)
E4F1 coordinates pyruvate metabolism and the activity of the elongator complex to ensure translation fidelity during brain development
- Michela Di Michele,
- Aurore Attina,
- Pierre-François Roux,
- Imène Tabet,
- Sophie Laguesse,
- Javier Florido,
- Morane Houdeville,
- Armelle Choquet,
- Betty Encislai,
- Giuseppe Arena,
- Carlo De Blasio,
- Olivia Wendling,
- François-Xavier Frenois,
- Laura Papon,
- Lucille Stuani,
- Maryse Fuentes,
- Céline Jahannault Talignani,
- Mélanie Rousseau,
- Justine Guégan,
- Yoan Buscail,
- Pierrick Dupré,
- Henri-Alexandre Michaud,
- Geneviève Rodier,
- Floriant Bellvert,
- Hanna Kulyk,
- Carole Ferraro Peyret,
- Hugo Mathieu,
- Pierre Close,
- Francesca Rapino,
- Cédric Chaveroux,
- Nelly Pirot,
- Lucie Rubio,
- Adeline Torro,
- Tania Sorg,
- Fabrice Ango,
- Christophe Hirtz,
- Vincent Compan,
- Elise Lebigot,
- Andrea Legati,
- Daniele Ghezzi,
- Laurent Nguyen,
- Alexandre David,
- Claude Sardet,
- Matthieu Lacroix,
- Laurent Le Cam
Affiliations
- Michela Di Michele
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Aurore Attina
- IRMB-PPC, Univ. Montpellier, INSERM, CHU Montpellier, CNRS
- Pierre-François Roux
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Imène Tabet
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Sophie Laguesse
- Laboratory of Molecular Regulation of Neurogenesis, GIGA Institute, University of Liège, CHU Sart Tilman
- Javier Florido
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Morane Houdeville
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Armelle Choquet
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Betty Encislai
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Giuseppe Arena
- Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB), University of Luxembourg
- Carlo De Blasio
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Olivia Wendling
- Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, CELPHEDIA, PHENOMIN, Institut Clinique de la Souris (ICS)
- François-Xavier Frenois
- Department of Pathology, CHU, Imag’IN Platform, IUCT-Oncopole
- Laura Papon
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Lucille Stuani
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Maryse Fuentes
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Céline Jahannault Talignani
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Mélanie Rousseau
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Justine Guégan
- Data Analysis Core Platform, Institut du Cerveau – Paris Brain Institute - ICM, Sorbonne Université, INSERM, CNRS, APHP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière
- Yoan Buscail
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Pierrick Dupré
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Henri-Alexandre Michaud
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Geneviève Rodier
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Floriant Bellvert
- MetaToul-MetaboHUB, National Infrastructure of Metabolomics and Fluxomics
- Hanna Kulyk
- MetaToul-MetaboHUB, National Infrastructure of Metabolomics and Fluxomics
- Carole Ferraro Peyret
- Univ. Lyon, Claude Bernard University, LBTI UMR CNRS 5305, Faculty of Pharmacy
- Hugo Mathieu
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Pierre Close
- Laboratory of Cancer Signaling, GIGA-Institute, University of Liège
- Francesca Rapino
- Laboratory of Cancer Signaling, GIGA-Institute, University of Liège
- Cédric Chaveroux
- Univ. Lyon, Claude Bernard University, LBTI UMR CNRS 5305, Faculty of Pharmacy
- Nelly Pirot
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Lucie Rubio
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Adeline Torro
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Tania Sorg
- Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, CELPHEDIA, PHENOMIN, Institut Clinique de la Souris (ICS)
- Fabrice Ango
- Institut des Neurosciences de Montpellier, Université de Montpellier, INSERM, CNRS
- Christophe Hirtz
- IRMB-PPC, Univ. Montpellier, INSERM, CHU Montpellier, CNRS
- Vincent Compan
- Institut de Génomique Fonctionnelle, Université de Montpellier, CNRS, INSERM
- Elise Lebigot
- Biochemistry Department, Bicêtre Hospital, APHP Paris Saclay
- Andrea Legati
- Unit of Medical Genetics and Neurogenetics, Fondazione IRCCS Istituto Neurologico Carlo Besta
- Daniele Ghezzi
- Unit of Medical Genetics and Neurogenetics, Fondazione IRCCS Istituto Neurologico Carlo Besta
- Laurent Nguyen
- Laboratory of Molecular Regulation of Neurogenesis, GIGA Institute, University of Liège, CHU Sart Tilman
- Alexandre David
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Claude Sardet
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Matthieu Lacroix
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Laurent Le Cam
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM), INSERM U1194, Univ. Montpellier, Institut régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-024-55444-y
- Journal volume & issue
-
Vol. 16,
no. 1
pp. 1 – 17
Abstract
Abstract Pyruvate metabolism defects lead to severe neuropathies such as the Leigh syndrome (LS) but the molecular mechanisms underlying neuronal cell death remain poorly understood. Here, we unravel a connection between pyruvate metabolism and the regulation of the epitranscriptome that plays an essential role during brain development. Using genetically engineered mouse model and primary neuronal cells, we identify the transcription factor E4F1 as a key coordinator of AcetylCoenzyme A (AcCoA) production by the pyruvate dehydrogenase complex (PDC) and its utilization as an essential co-factor by the Elongator complex to acetylate tRNAs at the wobble position uridine 34 (U34). E4F1-mediated direct transcriptional regulation of Dlat and Elp3, two genes encoding key subunits of the PDC and of the Elongator complex, respectively, ensures proper translation fidelity and cell survival in the central nervous system (CNS) during mouse embryonic development. Furthermore, analysis of PDH-deficient cells highlight a crosstalk linking the PDC to ELP3 expression that is perturbed in LS patients.