Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban (Sep 2008)

Sequence analysis of mitochondrial fragment COⅡ gene of H. labeo and H. maculates from Oujiang River(瓯江流域唇和花线粒体COⅡ基因部分序列分析)

  • LÜYao-ping(吕耀平),
  • HUZe-hui(胡则辉),
  • YELi-ping(叶丽平),
  • YAOZi-liang(姚子亮)

DOI
https://doi.org/10.3785/j.issn.1008-9497.2008.05.023
Journal volume & issue
Vol. 35, no. 5
pp. 580 – 585

Abstract

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采用PCR技术获得了唇(Hemibarbus labeo )和花(H. maculatus)线粒体DNA细胞色素氧化酶(COⅡ)基因部分序列,将所得的COⅡ基因序列与4种取自GenBank的属鱼类同一基因序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、种群遗传结构和分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,在实际分析的600 bp序列中,序列A+T含量(56.9%~57.8%)高于G+C含量,物种间共有变异位点116个,其中简约信息位点46个;唇和花2个地理种群间变异位点均为11个,唇种群间碱基替换均为转换,花的转换/颠换为8/3.以COⅡ基因片段序列为标记,用似刺鳊(Paracanthobrama guichenoti Bleeker)作外群,构建了属鱼类的系统发生树,其拓扑结构显示2个地理种群浙江花单倍体Ⅰ(H1)与江苏花首先聚为一支,然后与浙江花单倍体Ⅱ (H2)形成一个单系群.韩国唇和日本为姐妹群,然后与中国花(浙江和江苏)相聚为一支.长吻和朝鲜单独聚为一支,表明2者的亲缘关系较近.结果同时表明,韩国唇与江苏花、日本和浙江花(H1)的遗传距离均为0.008 4,结合形态特征鉴定,推测韩国唇和日本是中国花(浙江和江苏)的同物异名.

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