آنالیز بیوانفورماتیکی آنتی ژن های Omp25 و BLS بروسلا ملی تنسیس به منظور طراحی واکسن

Abstract

بروسلوز یکی از رایج ترین بیماری های دامی است که توسط باکتری گرم منفی بروسلا ایجاد می‌شود. با توجه به ضرر‌های جدی اقتصادی و درمانی این بیماری که برای دام و انسان همواره به ارمغان دارد تلاش‌های بسیاری جهت جلوگیری و درمان این بیماری توسط واکسن‌های نوترکیب بر پایه آنتی ژن‌های غشای پروتئینی خارجی صورت می‌گیرد. بدین منظور هدف از مطالعه حاضر بررسی خصوصیات بیوانفورماتیکی آنتی ژن های Omp25 و BLSبه عنوان یکی از آنتی ژن های غالب غشای پروتئینی باکتری بروسلا بوده است. به منظور انجام توالی‌یابی و بررسی فیلوژنتیکی، ژن تکثیر شده به ناقل pTZ57R/T انتقال داده شد. حضور ژن هدف در ناقل کلونینگ pTZ57R/T با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز و هضم آنزیمی تایید شد. نتایج این مطالعه نشان داد که این ژن همولوژی بالایی با دیگر گونه های بروسلا دارد. در این پژوهش از نرم افزار‌های بیوانفورماتیکی مختلفی برای پیش بینی اپی توپ‌های B و T ، ساختار دوم و سوم پروتئین، خصوصیات ایمنی زایی و ویژگی‌های هضم پروتئین استفاده گردید. پیش از استفاده از نرم افزار ها میزان دقت آنها توسط داده های تجربی اعتبار سنجی گردید. نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد ناحیه 154-162 Omp25 و نواحی 37-48 و 119-139 برای BLS به عنوان یک اپی توپ مشترک بین سلول های B و T جهت طراحی واکسن نوترکیب پیش بینی گردید.

Keywords

• بروسلا ملیتنسیس
• Omp25
• BLS
• تحلیل آمار حیاتی
• واکسن نوترکیب