تحقیقات تولیدات دامی (Dec 2024)
مقایسه ژنومی نژادهای گوسفند شیری کایاس و فریزارته از نظر شمار سلول‌های بدنی شیر با استفاده از روش‌های برآوردگر نااریب FST و hapFLK
Abstract
از شمار سلول‌های بدنی بهعنوان روشی غیرمستقیم برای کنترل ورم پستان استفاده می‌شود. هدف این پژوهش، مقایسه ژنومی دو نژاد گوسفند شیری کایاس و فریزارته از نظر شمار سلول‌های بدنی شیر بود. برای این منظور از اطلاعات ژنوتیپی 587 رأس دام با کمترین خویشاوندی و تعیین ژنوتیپ شده با آرایههای50K گوسفندی استفاده شد. برای شناسایی مناطق ژنومی از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST و hapFLK استفاده شد. ژنهای کاندیدا با استفاده از SNPهایی که در بازه 01/0 درصد ارزش بالای این دو آزمون واقع شده بودند شناسایی شدند. نتایج حاصل از آماره تتا به شناسایی نه ناحیه ژنومی روی کروموزومهای 2، 5، 7، 10، 11، 13 (دو ناحیه)، 17 و 22 منجر شد. ژنهای کاندیدای شناسایی شده شامل ژنهای IL11RA،CDC16 ،CARD14، BTRC،OTUD4 ، COL23A1، LACTB و PRELID3B بودند و عملکردهای متفاوتی با سیستم ایمنی، پاسخ ایمنی ذاتی، پاسخ التهابی، سرطان و تولید شیر داشتند. نتایج حاصل از آماره hapFLK به شناسایی شش ناحیه ژنومی روی کروموزومهای 3، 4، 5، 7، 10 و 13 منجر شد. ژنهای کاندیدای شناسایی شده شامل FAM49A، CDK6 و DLGAP5 بودند و عملکردهای متفاوتی در ایمنی ذاتی و انواع سرطان داشتند. با توجه به اینکه تحقیقات اندکی در رابطه با شمار سلول‌های بدنی شیر در گوسفندان نژاد شیری انجام شده است، نتایج این تحقیق می‌تواند اطلاعات ارزشمندی در رابطه با شمار سلول‌های بدنی شیر ارایه دهد. به هر حال، بهمنظور درک بهتر ژنهای مؤثر بر این صفت مهم ضروری است پژوهش‌های گسترده‌تر با تعداد نمونه‌های بیشتری انجام شود.
Keywords
