Nature Communications (Nov 2017)
Carrageenan catabolism is encoded by a complex regulon in marine heterotrophic bacteria
- Elizabeth Ficko-Blean,
- Aurélie Préchoux,
- François Thomas,
- Tatiana Rochat,
- Robert Larocque,
- Yongtao Zhu,
- Mark Stam,
- Sabine Génicot,
- Murielle Jam,
- Alexandra Calteau,
- Benjamin Viart,
- David Ropartz,
- David Pérez-Pascual,
- Gaëlle Correc,
- Maria Matard-Mann,
- Keith A. Stubbs,
- Hélène Rogniaux,
- Alexandra Jeudy,
- Tristan Barbeyron,
- Claudine Médigue,
- Mirjam Czjzek,
- David Vallenet,
- Mark J. McBride,
- Eric Duchaud,
- Gurvan Michel
Affiliations
- Elizabeth Ficko-Blean
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Aurélie Préchoux
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- François Thomas
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Tatiana Rochat
- VIM, INRA, Université Paris-Saclay
- Robert Larocque
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Yongtao Zhu
- Department of Biological Sciences, University of Wisconsin-Milwaukee
- Mark Stam
- UMR 8030, CNRS, Université Évry-Val-d’Essonne, CEA, Institut de Génomique - Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
- Sabine Génicot
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Murielle Jam
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Alexandra Calteau
- UMR 8030, CNRS, Université Évry-Val-d’Essonne, CEA, Institut de Génomique - Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
- Benjamin Viart
- UMR 8030, CNRS, Université Évry-Val-d’Essonne, CEA, Institut de Génomique - Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
- David Ropartz
- INRA, UR1268 Biopolymers Interactions Assemblies
- David Pérez-Pascual
- VIM, INRA, Université Paris-Saclay
- Gaëlle Correc
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Maria Matard-Mann
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Keith A. Stubbs
- School of Molecular Sciences, The University of Western Australia
- Hélène Rogniaux
- INRA, UR1268 Biopolymers Interactions Assemblies
- Alexandra Jeudy
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Tristan Barbeyron
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- Claudine Médigue
- UMR 8030, CNRS, Université Évry-Val-d’Essonne, CEA, Institut de Génomique - Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
- Mirjam Czjzek
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- David Vallenet
- UMR 8030, CNRS, Université Évry-Val-d’Essonne, CEA, Institut de Génomique - Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme
- Mark J. McBride
- Department of Biological Sciences, University of Wisconsin-Milwaukee
- Eric Duchaud
- VIM, INRA, Université Paris-Saclay
- Gurvan Michel
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-017-01832-6
- Journal volume & issue
-
Vol. 8,
no. 1
pp. 1 – 17
Abstract
Carrageenans, major cell wall polysaccharides of red macroalgae, are metabolised by marine heterotrophic bacteria through unclear mechanisms. Here, the authors identify an unusual polysaccharide-utilization locus encoding carrageenan catabolism in a marine bacterium, and characterise the complete pathway.
