Nature Communications (Jul 2016)
A whole-genome sequence and transcriptome perspective on HER2-positive breast cancers
- Anthony Ferrari,
- Anne Vincent-Salomon,
- Xavier Pivot,
- Anne-Sophie Sertier,
- Emilie Thomas,
- Laurie Tonon,
- Sandrine Boyault,
- Eskeatnaf Mulugeta,
- Isabelle Treilleux,
- Gaëtan MacGrogan,
- Laurent Arnould,
- Janice Kielbassa,
- Vincent Le Texier,
- Hélène Blanché,
- Jean-François Deleuze,
- Jocelyne Jacquemier,
- Marie-Christine Mathieu,
- Frédérique Penault-Llorca,
- Frédéric Bibeau,
- Odette Mariani,
- Cécile Mannina,
- Jean-Yves Pierga,
- Olivier Trédan,
- Thomas Bachelot,
- Hervé Bonnefoi,
- Gilles Romieu,
- Pierre Fumoleau,
- Suzette Delaloge,
- Maria Rios,
- Jean-Marc Ferrero,
- Carole Tarpin,
- Catherine Bouteille,
- Fabien Calvo,
- Ivo Glynne Gut,
- Marta Gut,
- Sancha Martin,
- Serena Nik-Zainal,
- Michael R. Stratton,
- Iris Pauporté,
- Pierre Saintigny,
- Daniel Birnbaum,
- Alain Viari,
- Gilles Thomas
Affiliations
- Anthony Ferrari
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Anne Vincent-Salomon
- Département de Pathologie, Institut Curie, PSL Research University
- Xavier Pivot
- Centre Hospitalier Universitaire de Minjoz
- Anne-Sophie Sertier
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Emilie Thomas
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Laurie Tonon
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Sandrine Boyault
- Plateforme de génomique des cancers, Centre Léon Bérard
- Eskeatnaf Mulugeta
- Institut Curie, UMR 3215 CNRS, Génétique et biologie du développement, Epigénèse et développement des mammifères
- Isabelle Treilleux
- Département de Pathologie, Centre Léon Bérard
- Gaëtan MacGrogan
- Département de Biopathologie, Unité Inserm U916, Institut Bergonié
- Laurent Arnould
- Centre Georges-François Leclerc et CRB Ferdinand Cabanne
- Janice Kielbassa
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Vincent Le Texier
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Hélène Blanché
- Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH), Fondation Jean Dausset
- Jean-François Deleuze
- Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH), Fondation Jean Dausset
- Jocelyne Jacquemier
- Département de Pathologie, Institut Paoli-Calmettes
- Marie-Christine Mathieu
- Institut Gustave Roussy, Comité de Pathologie Mammaire
- Frédérique Penault-Llorca
- Département de Biopathologie, Centre Jean Perrin, EA 4677 ERTICa, Université d'Auvergne
- Frédéric Bibeau
- Département de Pathologie, Institut Régional du Cancer de Montpellier (ICM)
- Odette Mariani
- Institut Curie, PSL Research University, Service de Pathologie, Centre de Ressources Biologiques
- Cécile Mannina
- Département de Pathologie, Institut Bergonié
- Jean-Yves Pierga
- Département d'Oncologie Médicale, Institut Curie, PSL Research University, Université Paris Descartes
- Olivier Trédan
- Département de Cancérologie Médicale, Centre Léon Bérard
- Thomas Bachelot
- Département de Cancérologie Médicale, Centre Léon Bérard
- Hervé Bonnefoi
- Department of Medical Oncology, Institut Bergonié Unicancer, University of Bordeaux
- Gilles Romieu
- Institut Régional du Cancer de Montpellier (ICM), Oncologie Sénologie
- Pierre Fumoleau
- Centre Georges-François Leclerc et CRB Ferdinand Cabanne
- Suzette Delaloge
- Institut Gustave Roussy, Comité de Pathologie Mammaire
- Maria Rios
- Département d’Oncologie Médicale, Centre Alexis Vautrin
- Jean-Marc Ferrero
- Département d'Oncologie Médicale, Centre Antoine Lacassagne
- Carole Tarpin
- Département d’Oncologie Médicale, Institut Paoli-Calmettes
- Catherine Bouteille
- Clinique Mutualiste de Bellevue, Chirurgie Gynécologique et Mammaire
- Fabien Calvo
- Institut Gustave Roussy, Cancer Core Europe
- Ivo Glynne Gut
- CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG)
- Marta Gut
- CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG)
- Sancha Martin
- Wellcome Trust Sanger Institute
- Serena Nik-Zainal
- Wellcome Trust Sanger Institute
- Michael R. Stratton
- Wellcome Trust Sanger Institute
- Iris Pauporté
- Département de Recherche Clinique, Institut National du Cancer
- Pierre Saintigny
- INSERM U1052-CNRS 5286, Cancer Research Center of Lyon
- Daniel Birnbaum
- Département d’Oncologie Moléculaire, Institut Paoli-Calmettes, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille
- Alain Viari
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- Gilles Thomas
- Synergie Lyon Cancer, Plateforme de bioinformatique ‘Gilles Thomas’ Centre Léon Bérard
- DOI
- https://doi.org/10.1038/ncomms12222
- Journal volume & issue
-
Vol. 7,
no. 1
pp. 1 – 9
Abstract
Breast cancer is separated into multiple subtypes based on the expression of HER2 and hormone receptors. Here, the authors report the whole genome sequence of 64 HER2 positive tumours and show that these can be further separated into four groups with different gene expression profiles and genomic features.