نشانه‌های انتخاب مرتبط با صفت تعداد بره در هر نوبت زایش میش‌های بلوچی

Abstract

تعداد بره در هر زایش، یکی از مهم‌ترین صفات اقتصادی و تولیدمثلی در گوسفند است. در این پژوهش از داده­های 96 رأس میش نژاد بلوچی تعیین ژنوتیپ شده با استفاده از ریزآرایه‌های نانویی گوسفندی K50 برای شناسایی نواحی ژنومی مورد انتخاب مرتبط با تعداد بره در هر زایش در گوسفند استفاده شد. میش‌ها بر اساس داده­های فنوتیپی پنج شکم زایش به دو گروه مورد (دوقلوزا) و شاهد (تک­قلوزا) تقسیم شدند. برای شناسایی نشانه‌های انتخاب از آماره‌های FST و XP-EHH به ترتیب در بسته نرم‌افزاری FST و EHH و برای تجزیه هستی‌شناسی ژن‌های شناسایی شده در مناطق مورد انتخاب از پایگاه داده DAVID استفاده شد. نتایج این پژوهش منجر به شناسایی 14 ناحیه ژنومی روی کروموزوم­های 1 و 2 (دو ناحیه برای هر کدام)، 3، 7، 9، 14، 18، 22 و 23 (هر کدام یک ناحیه) و کروموزوم X (3 ناحیه) با آماره FST و 9 ناحیه ژنومی روی کروموزوم‌های 13،12،2 و 22 (یک ناحیه برای هر کدام)، 7 (سه ناحیه) و X (دو ناحیه) با آماره XP-EHH شد. برخی از ژن‌های شناسایی شده در مناطق مورد انتخاب با تعداد بره در هر زایش (ACVR1 وTGIF1 )، رشد تخمدان و فولیکول (DDX24) و باروری (FOXH1) مرتبط بودند. در مسیرهای زیستی شناسایی ‌شده، دو مسیر پاسخ دفاعی و تحرک سلولی دارای نقش مهمی در نرخ تخمک­ریزی و تعداد بره در هر زایش بودند. نتایج این مطالعه نشان داد که ژن‌های ACVR1 و TGIF1را می‌توان به ‌عنوان ژن‌های کاندید مرتبط با تعداد بره در هر زایش در برنامه‌های اصلاح نژادی گوسفند در نظر گرفت.

Keywords

• آماره fst
• آماره xp-ehh
• تعداد بره در هر زایش
• گوسفند بلوچی
• نشانه‌های انتخاب