Nature Communications (May 2018)
Distinct epigenetic landscapes underlie the pathobiology of pancreatic cancer subtypes
- Gwen Lomberk,
- Yuna Blum,
- Rémy Nicolle,
- Asha Nair,
- Krutika Satish Gaonkar,
- Laetitia Marisa,
- Angela Mathison,
- Zhifu Sun,
- Huihuang Yan,
- Nabila Elarouci,
- Lucile Armenoult,
- Mira Ayadi,
- Tamas Ordog,
- Jeong-Heon Lee,
- Gavin Oliver,
- Eric Klee,
- Vincent Moutardier,
- Odile Gayet,
- Benjamin Bian,
- Pauline Duconseil,
- Marine Gilabert,
- Martin Bigonnet,
- Stephane Garcia,
- Olivier Turrini,
- Jean-Robert Delpero,
- Marc Giovannini,
- Philippe Grandval,
- Mohamed Gasmi,
- Veronique Secq,
- Aurélien De Reyniès,
- Nelson Dusetti,
- Juan Iovanna,
- Raul Urrutia
Affiliations
- Gwen Lomberk
- Division of Research, Department of Surgery, Medical College of Wisconsin
- Yuna Blum
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Rémy Nicolle
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Asha Nair
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Krutika Satish Gaonkar
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Laetitia Marisa
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Angela Mathison
- Genomic Sciences and Precision Medicine Center, Medical College of Wisconsin
- Zhifu Sun
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Huihuang Yan
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Nabila Elarouci
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Lucile Armenoult
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Mira Ayadi
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Tamas Ordog
- Epigenomics Program, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic
- Jeong-Heon Lee
- Epigenomics Program, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic
- Gavin Oliver
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Eric Klee
- Division of Biomedical Statistics and Informatics, Department of Health Science Research, Mayo Clinic
- Vincent Moutardier
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Odile Gayet
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Benjamin Bian
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Pauline Duconseil
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Marine Gilabert
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Martin Bigonnet
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Stephane Garcia
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Olivier Turrini
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Jean-Robert Delpero
- Institut Paoli-Calmettes
- Marc Giovannini
- Institut Paoli-Calmettes
- Philippe Grandval
- Hôpital de la Timone
- Mohamed Gasmi
- Hôpital Nord, Chemin des Bourrely
- Veronique Secq
- Hôpital Nord, Chemin des Bourrely
- Aurélien De Reyniès
- Programme Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT), Ligue Nationale Contre Le Cancer
- Nelson Dusetti
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Juan Iovanna
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), INSERM U1068, CNRS UMR 7258, Aix-Marseille Université and Institut Paoli-Calmettes, Parc Scientifique et Technologique de Luminy
- Raul Urrutia
- Division of Research, Department of Surgery, Medical College of Wisconsin
- DOI
- https://doi.org/10.1038/s41467-018-04383-6
- Journal volume & issue
-
Vol. 9,
no. 1
pp. 1 – 10
Abstract
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a complex disease and its underlying epigenomic heterogeneity is not fully understood. Here, the authors utilize patient-derived PDAC xenografts to define the epigenomic landscape of PDAC, highlighting chromatin states linked to differing disease aggressiveness and survival.
