Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban (Jan 2012)

Pharmacophore model construction of glycogen synthase kinase-3 inhibitors(GSK-3抑制剂药效团模型的构建)

  • LÜYang(吕杨),
  • JIANGYong-jun(蒋勇军),
  • PANShan-fei(潘善飞),
  • DAINa(代娜),
  • LUOHai-bin(罗海彬)

DOI
https://doi.org/10.3785/j.issn.1008-9497.2012.01.013
Journal volume & issue
Vol. 39, no. 1
pp. 60 – 66

Abstract

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选择活性跨越0.08〜100 000 nmol • L-1的8类共30个GSK-3竞争性抑制剂小分子作为训练集,其余490个不同结构和活性的小分子作为测试集.采用Accelrys Discovery Stutio Client 2. 5软件,筛选得到由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水中心、1个环芳香性和1个排除体积组成的最佳模型(Correl=0. 900,Config=13. 962,Δcost=90. 725), 采用测试集与分子对接方法对模型进行评价,表明该模型具有较强的预测能力,为进一步的数据库搜索及寻找新型GSK-3抑制剂先导物提供了依据.

Keywords