First Detection and Characterization of <i>Smacovirus</i> in the Human Vagina in Two Sequential Samples over a Twelve-Day Interval
Antonio Charlys da Costa,
Tania Regina Tozetto-Mendoza,
Endrya do Socorro Foro Ramos,
Pietro Bortoletto,
Noely Evangelista Ferreira,
Layla Honorato,
Erick Matheus Garcia Barbosa,
Heuder Gustavo Oliveira Paião,
Amanda Fernandes de Souza,
Iara M. Linhares,
Steven D. Spandorfer,
Elcio Leal,
Maria Cassia Mendes-Correa,
Steven S. Witkin
Affiliations
Antonio Charlys da Costa
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Tania Regina Tozetto-Mendoza
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Endrya do Socorro Foro Ramos
Laboratório de Diversidade Viral, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, Brazil
Pietro Bortoletto
Boston IVF-The Eugin Group, Waltham 02451, MA, USA
Noely Evangelista Ferreira
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Layla Honorato
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Erick Matheus Garcia Barbosa
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Heuder Gustavo Oliveira Paião
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Amanda Fernandes de Souza
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Iara M. Linhares
Department of Gynecology and Obstetrics, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil
Steven D. Spandorfer
Center for Reproductive Medicine and Infertility, Weill Cornell Medicine, New York 10001, NY, USA
Elcio Leal
Laboratório de Diversidade Viral, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, Brazil
Maria Cassia Mendes-Correa
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Steven S. Witkin
Laboratorio de Virologia (LIM52), Departamento de Infectologia e Medicina Tropical, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr Enéas de Carvalho Aguiar, 470, São Paulo 05403-000, Brazil
Background: Smacovirus is a CRESS-DNA virus identified almost exclusively in transient fecal samples from various vertebrate species. Objective: We evaluated human vaginal samples for the presence and maintenance of Smacovirus. Methods: Viral metagenomics analysis was performed on vaginal samples collected from 28 apparently healthy women in New York City, USA. Twenty-one of the women provided duplicate samples over a 12–21-day interval. Results: Phylogenetic analysis identified two samples from the same individual, collected over a twelve-day interval, that were positive for the complete Smacovirus genome. All detected sequence contigs belonged to a single variant of CRESS-DNA. Conclusions: The continuous presence of Smacovirus in the human vagina over a twelve-day period was identified.
