СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНОЙ И АМИНОКИСЛОТНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ БЕЛКА ХИМОЗИНА В ЭВОЛЮЦИОННОМ РЯДУ МЛЕКОПИТАЮЩИХ

Abstract

В статье представлены результаты по сравнительному анализу аминокислотной и нуклеотидной последовательности экзонов химозина в области каталитического центра (в положении 25-220) млекопитающих различных сред обитания, с различным рационом питания используя инструменты филогенетического анализа. Получены данные по выравниванию нуклеотидной и аминокислотной последовательности экзонов химозина, определены консервативные и вариабельные участки, проведен попарный сравнительный анализ нуклеотидной и аминокислотной идентичности, определен спектр встречаемости аминокислот по белку в целом и в области каталитического центра. В ходе филогенетического анализа по дендрограмме, построенной для нуклеотидной последовательности гена химозина, выделены клады шести групп, которые сформировали представители анализируемых семейств. Полученные данные, могут использоваться для прогнозирования пищеварительных и иммунных функций белка на клеточном уровне.

Keywords

• химозин
• 3d модели белка
• выравнивание аминокислотной и нуклеотидной последовательности
• эволюционный ряд позвоночных млекопитающих
• chymosin
• 3d protein models
• amino acid and nucleotide sequence alignment
• evolutionary lineage of vertebrate mammals