مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند

Abstract

چندقلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در گوسفند با تنوع داخل و بین نژادی است. این مطالعه به منظور شناسایی مکان­های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند با رویکرد مگاآنالیز مطالعه ارتباط ژنومی و با استفاده از داده­های ژنوتیپی و فنوتیپی شش نژاد گوسفند از پایگاه داده انجام شد. کنترل کیفیت با استفاده از نرم ‌افزار Plink و ایمپیوتیشن با روش LD-kNNi انجام شد. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم افزار TASSEL با در نظر گرفتن خویشاوندی و ساختار جمعیت انجام شد. پس از پایان کنترل کیفیت، تعداد 305 حیوان و 351615 نشانگر SNP با متوسط MAF برابر با 33/0 برای ادامه تجزیه مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج مگاآنالیز، یک SNP را روی کروموزوم 21 در سطح ژنوم و 10 SNP در سطح کروموزومی روی کروموزوم های 1، 2، 3، 14، 17 و 22 شناسایی کرد که به­طور معنی­داری با چندقلوزایی در گوسفند در ارتباط بودند. ژن­های OPCML، GULP1، RBP4، MMP2 و LPCAT2 شناسایی شده در این تحقیق، نقش موثری در باروری و موفقیت آبستنی دارند. نتایج این تحقیق می‌تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل­کننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.

Keywords

• چندقلوزایی
• گوسفند
• مطالعه ارتباط ژنومی
• مگاآنالیز
• نشانگر