Archives of Razi Institute (Nov 2013)

معرفی یک روش مقرون به صرفه استخراج DNA از سالمونلا انتریکا انتریتیدیس مناسب برای آزمون های واکنش زنجیره ای پلیمراز

  • رایناک قادری,
  • سهیلا مرادی بیدهندی,
  • حبیب اله پایکاری,
  • کیوان تدین,
  • نسیم کریم نسب,
  • محمدهادی سخاوتی,
  • فرزاد اسدی

DOI
https://doi.org/10.7508/ari.2013.02.003
Journal volume & issue
Vol. 68, no. 2
pp. 105 – 109

Abstract

Read online

روش های سریع و کم هزینه استخراج ماده ژنومی باکتری ها در آزمایشگاه های میکروب شناسی تشخیصی و تحقیقاتی معمولا از مقبولیت بیشتری برخوردار هستند. آنزیم های نوکلئاز موجود در باکتری ها که در جریان استخراج ماده ژنومی آزاد می گردند می توانند سبب تخریب ماده ژنتیکی آنها و اختلال در نتایج آزمون های واکنش زنجیره ای پلیمراز بگردند. در مطالعه حاضر هنگامی که استخراج شده از سالمونلا انتریکا انتریتیدیس به چهار روش جوشانیدن ساده در بافر TE ، جوشانیدن در بافر TE محتوی پروتئیناز K ، فنل- کلروفرم-آیزوآمیل الکل و بالاخره کیت تجارتی در یک آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی بنام STM2-PCR بر روی یک سروتایپ استاندارد آزمایشگاهی و یک جدایه کلینیکی بکار گرفته شدند محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز هر چهار روش بجز نمونه حاصل از روش جوشانیدن ساده پایداری خود در دمای 4 درجه سانتیگراد را بمدت 28 روز حفظ نمودند. این تحقیق با هدف ارزیابی امکان یافتن راهکاری برای بهینه سازی روش ساده جوشانیدن باکتری که بتواند پایداری محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز را تضمین نماید صورت پذیرفته است. یافته کاربردی این مطالعه آن است که جوشانیدن باکتری در بافر TE محتوی 0.02 mg/µl پروتئیناز K ، ضمن آنکه بسرعت و با حداقل هزینه قابل انجام می باشد می تواند در آزمایشگاه هایی که با تعداد زیادی نمونه سالمونلا سروکار دارند مورد استفاده قرار گیرد .

Keywords