Identificación fenotípica y molecular de aislamientos clínicos y ambientales de Fusarium spp.

Abstract

Antecedentes: Fusarium es un género de hongos cuya identificación se basa principalmente en características fenotípicas. Los procedimientos de biología molecular han superado a los convencionales. En México, no existe información de las especies o complejos de los miembros de este hongo. Objetivo: Identificar las especies de 116 cepas Fusarium spp. obtenidas de muestras clínicas y ambientales. Material y métodos: La identificación fenotípica se llevó a cabo en agar dextrosa de Sabouraud, agar papa dextrosa, agar avena, agar Speziller Nährstoffarmer y agar agua. La identificación molecular se realizó por amplificación y secuenciación de las regiones ITS, factor de elongación 1-alfa, región de RNA polimerasa II subunidad B, y calmodulina. Resultados: Solo se identificaron 39 cepas de Fusarium spp. mediante características fenotípicas, las cuales fueron confirmadas. Las restantes 77 se reconocieron mediante procedimientos de biología molecular. La secuenciación de ITS fue suficiente para las especies de los complejos Fusarium oxysporum y Fusarium solani. Para la identificación de otras especies, se requirió la secuenciación del factor de elongación 1-alfa, región de ARN polimerasa II subunidad B y/o calmodulina. Conclusiones: La identificación fenotípica estuvo limitada frecuentemente por la nula producción de estructuras fúngicas en los cultivos. Son indispensables los procedimientos moleculares para lograr la distinción precisa de las especies de este género.

Keywords

• Calmodulina. Factor elongación. Fusarium. Identificación fenotípica. ITS. Región de ARN polimerasa II subunidad B.