پژوهشهای علوم دامی ایران (Jul 2020)
شناسایی ژنهای میتوکندریایی تأثیر‌گذار بر تکامل سلول تخم تحت هورمون FSH با استفاده از دادههای ریز آرایه در گاو
Abstract
بلوغ تخمک شامل بلوغ هستهای و سیتوپلاسمی است که هر دو برای لقاح و نمو رویان اهمیت دارد. برخلاف بلوغ هستهای، بلوغ سیتوپلاسمی اووسیت را نمیتوان به راحتی ارزیابی کرد. با توجه به توزیع مجدد برخی اندامکها از جمله میتوکندری در زمان بلوغ میتوان آن را به عنوان شاخص بلوغ سیتوپلاسمی در نظر گرفت. در این مطالعه به منظور بررسی اثر هورمون FSH در شرایط آزمایشگاهی بر چگونگی بیان ژنهای میتوکندریایی، دادههای ریزآرایه حاوی اطلاعات بیان ژن سلولهای اووسیت گاو، با کد دسترسی GEO ( (GSE38345 استفاده گردید. آنالیز و مقایسه بیان ژنها در دو حالت قبل و بعد از بلوغ به ترتیب (20 و 96 ساعت بعد از تیمار) با استفاده از لینک نرمافزاری GEO2R، دو گروه ژنهای افزایش و کاهش بیان یافته را تعیین نمود. برهمکنش گروههای ژنی با استفاده از پایگاه اطلاعاتی string، مجسمسازی شبکه با استفاده از نرمافزار cytoscape و هستیشناسی شبکه با استفاده از پایگاه اطلاعاتی comparative GO انجام گردید. در شبکه برهمکنش پروتئینی مربوط به ژنهای افزایش بیان یافته، ژنهای مهمMRPS10 ، MRPS18A، MRPL16 و MRPL17 که در فرایندهای انهدام میتوکندری و ترجمه ژنهای این اندامک و در شبکه ژنهای کاهش بیان یافته، ژنهایMRPL22، ATP5Bو ATP5C1که با کاهش بیان خود، سعی در ایجاد تعادل در مسیرهای مرتبط با انهدام میتوکندری و تولید ATP از طریق نقش در ساختار ATP سنتتاز، داشتند. در این مطالعه ژنهای تنظیم کننده و همچنین مسیرهای بیولوژیکی مؤثر به منظور درک ساز و کار اثر هورمون FSH بر روند بلوغ اووسیت از طریق اندامک میتوکندری بررسی گردیده است.
Keywords
