Impact of the use of molecular techniques (PCR) on detection and eradication success against Helicobacter pylori

Abstract

Introduction: Helicobacter pylori infection affects more than 50% of the world population. Increased antibiotic resistance is the main cause of treatment failure. The main objective was to analyze the eradication success after the application of the new ESPGHAN treatment recommendations and the introduction of PCR as a direct diagnosis technique, describe the evolution of the local pattern of antibiotic resistance, and assess the cost-effectiveness of PCR application, isolated or in conjunction with culture as a diagnostic strategy. Patients and methods: Retrospective descriptive study of all microbiological isolates of Helicobacter pylori in 2013–2019 in our center, by comparing the percentage of resistance and eradication success between the periods 2013−2016 and 2017−2019. Cost-effectiveness study of direct diagnostic tests, comparing 3 different options: culture and PCR; only culture; PCR only. Results: 192 patients were included, 98 were detected by culture (2013−2016) and 94 by culture and/or PCR (2017−2019). Antibiotic treatment was established in 153 patients, 90 in the first period (2011 ESPGHAN guidelines: eradication percentage 62.2%), 63 in the second (2017 ESPGHAN guidelines: eradication percentage: 73%). An increase in resistance to clarithromycin was observed, going from 16.3% (n = 16) in the first period, to 53.2% (n = 48) in 2017−2019 (98% detected by PCR, 60% by culture). There were no differences in the rest of antibiotic resistances. The isolated PCR application presented a cost-effectiveness analysis ratio (CEAR) of 71.91, compared to 92.16 for the culture and 96.35 for the culture and PCR combined. Conclusions: The application of the ESPGHAN 2017 guidelines achieved greater eradication success, although less than that observed in previous publications, without reaching the target of at least 90%. An increase in resistance to macrolides was observed, without being able to discriminate whether it is a real increase or a greater diagnostic sensitivity of molecular techniques, with the isolated request for PCR being the most cost-effective strategy. Resumen: Introducción: La infección por Helicobacter pylori afecta a más del 50% de la población mundial. El aumento en las resistencias antibióticas es la principal causa del fracaso del tratamiento. El objetivo principal fue analizar el éxito erradicador tras la aplicación de las nuevas recomendaciones de tratamiento ESPGHAN e introducción de la PCR como técnica de diagnóstico directo, describir la evolución del patrón local de resistencias antibióticas y valorar el coste-efectividad de la aplicación de la PCR aislada o en conjunto con el cultivo como estrategia diagnóstica. Pacientes y métodos: Estudio descriptivo retrospectivo del total de aislamientos microbiológicos de Helicobacter pylori entre 2013–2019 en nuestro centro, mediante comparación del porcentaje de resistencias y éxito erradicador entre los periodos 2013−2016 y 2017−2019. Estudio de coste-efectividad de las pruebas de diagnóstico directo, comparando 3 opciones distintas: cultivo y PCR; solo cultivo; solo PCR. Resultados: Se incluyeron 192 pacientes, 98 fueron detectados por cultivo (2013−2016) y 94 por cultivo y/o PCR (2017−2019). Se instauró tratamiento antibiótico en 153 pacientes, 90 en el primer periodo (pautas ESPGHAN 2011: porcentaje erradicación 62.2%), 63 en el segundo (pautas ESPGHAN 2017: porcentaje erradicación: 73%). Se observó un aumento en las resistencias a claritromicina, pasando de un 16.3% (n = 16) en el primer periodo, a un 53.2% (n = 48) entre 2017−2019 (98% detectadas por PCR, 60% por cultivo). No hubo diferencias en el resto de resistencias antibióticas. La solicitud aislada de la PCR presentó un ratio de análisis de coste-efectividad (CEAR) de 71.91, en comparación con un 92,16 del cultivo y un 96.35 del cultivo y la PCR de forma conjunta. Conclusiones: La aplicación de las pautas ESPGHAN 2017 consiguió un mayor éxito de erradicación, aunque menor que lo observado en publicaciones previas, sin llegar al objetivo marcado de al menos un 90%. Se observó un incremento en las resistencias a macrólidos, sin poder discriminar si se trata de un aumento real o de una mayor sensibilidad diagnóstica de las técnicas moleculares, siendo la solicitud aislada de la PCR la estrategia más coste efectiva.

Keywords

• Helicobacter pylori
• Resistencia a medicamentos
• Tratamiento farmacológico
• Técnicas de cultivo
• Reacción en cadena de la polimerasa
• Evaluación de costo-efectividad