بررسی تکنیک PCR-DGGE برای شناسایی گونه‌های مختلف کاندیدا

Abstract

کاندیدا از جمله شایعترین مخمرهای عفونت زای انسانی می‌باشد و در سال‌های اخیر نرخ عفونت‌های ایجاد شده توسط این مخمر افزایش یافته است. شناسایی زود هنگام کاندیدا‌های بیماری زا نقش مهمی را برای انجام اقدامات درمانی و کنترل عفونت‌های بیمارستانی ایفا می‌نماید. روش‌های سنتی شناسایی کاندیدا نسبت به روش‌های مولکولی از حساسیت کمتری برخوردار بوده و به زمان بیشتری نیاز دارند. با توجه به وجود برخی محدودیت‌ها در روش‌های مولکولی مورد استفاده، در این مطالعه امکان استفاده از تکنیک PCR-DGGE برای شناسایی 5 گونه‌ی کاندیدای بیماریزا یعنی کاندیدا پاراپسیلوسیس، کاندیدا گلابراتا، کاندیدا تروپیکالیس، کاندیدا آلبیکنس و کاندیدا ارتوپسیلوسیس ارزیابی شد. بدین منظور ناحیه‌ی ITS2 با استفاده از پرایمر‌های ITS3-GC و ITS4 تکثیر شد و از محصولات به دست آمده در DGGE استفاده شد و نشان داده شد این تکنیک توانایی شناسایی گونه‌های مورد بررسی را دارا می‌باشد.

Keywords

• کاندیدا
• DGGE
• PCR