Association of the rs1966265 and rs351855 <i>FGFR4</i> Variants with Colorectal Cancer in a Mexican Population and Their Analysis In Silico
Irving Alejandro Carrillo-Dávila,
Asbiel Felipe Garibaldi-Ríos,
Luis E. Figuera,
Belinda Claudia Gómez-Meda,
Guillermo M. Zúñiga-González,
Ana María Puebla-Pérez,
Patricia Montserrat García-Verdín,
Paola Beatriz Castro-García,
Itzae Adonai Gutiérrez-Hurtado,
Blanca Miriam Torres-Mendoza,
Martha Patricia Gallegos-Arreola
Affiliations
Irving Alejandro Carrillo-Dávila
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Asbiel Felipe Garibaldi-Ríos
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Luis E. Figuera
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Belinda Claudia Gómez-Meda
Departamento de Biología Molecular y Genómica, Centro Universitario de Ciencias de la Salud (CUCS), Universidad de Guadalajara (UdeG), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Guillermo M. Zúñiga-González
División de Medicina Molecular, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Ana María Puebla-Pérez
Laboratorio de Inmunofarmacología, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías (CUCEI), Universidad de Guadalajara (UdeG), Guadalajara 44430, Jalisco, Mexico
Patricia Montserrat García-Verdín
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Paola Beatriz Castro-García
Laboratorio de Inmunofarmacología, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías (CUCEI), Universidad de Guadalajara (UdeG), Guadalajara 44430, Jalisco, Mexico
Itzae Adonai Gutiérrez-Hurtado
Departamento de Biología Molecular y Genómica, Centro Universitario de Ciencias de la Salud (CUCS), Universidad de Guadalajara (UdeG), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Blanca Miriam Torres-Mendoza
Laboratorio de Inmunodeficiencias Humanas y Retrovirus, División de Neurociencias, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
Martha Patricia Gallegos-Arreola
División de Genética, Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO), Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara 44340, Jalisco, Mexico
The aim of this study was to associate FGFR4 rs1966265 and rs351855 variants with colorectal cancer (CRC) in a Mexican population and to perform in silico analysis. Genomic DNA from 412 healthy individuals and 475 CRC patients was analyzed. In silico analysis was performed using the PolyPhen-V2, GEPIA, GTEx, and Cytoscape platforms. The GA genotype dominant model (GAAA) of rs1966265 and the AA genotype dominant and recessive models of rs351855 were identified as CRC risk factors (p p p p EFNA4, SLC3A2, and HNF1A share signaling pathways with FGFR4. Therefore, rs1966265 and rs351855 may be potential CRC risk factors.
