پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رُد آیلند رِد با استفاده از روش های بیزی

Abstract

تحقیق حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی و ژن­های کاندیدای مرتبط با صفات وزن تخم ­مرغ، بر اساس پویش ژنومی با استفاده از تراشه پربرون­داد Affymetrix 600K chip در 1078 پرنده نسل یازدهم مرغ نژاد رُد آیلند رِد انجام شد. برای هر پرنده، هفت صفت شامل وزن تخم­ مرغ در اولین تخم­گذاری، و وزن تخم مرغ در سنین 28، 36، 56، 66، 72 و 80 هفتگی جمع­آوری شده بود. ارتباط بین هر یک از نشانگرهای چندشکل تک نوکلئوتیدی (SNP) و صفات مختلف با استفاده از روش­های بیز A و B در نرم­افزار GenSel نسخه 90/4 بررسی شد. در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد روش بیز A از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش بیز B دارای عملکرد بهتری بود. تعداد نه نشانگر حاصل از روش بیزA با بیشترین میزان واریانس ژنتیکی روی کروموزوم­های شماره 1، 3، 5 و 20 قرار داشتند. SNP­های شناسایی شده در نزدیکی 35 ژن قرار گرفته بودند که از این میان، ژن­های کاندیدای BPIFB2، OCX36، CPT1A، TCF15، CECR2، SIAH3، FADS1، FADS2 و SGK1 عملکردهای مهمی را در فرآیند تولید تخم ­مرغ از راه تشکیل پروتئین آلبومین، سوخت و ساز اسیدهای چرب و تشکیل پوسته تخم مرغ داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می­دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولاً روش­ بیز A بر روش بیز B برتری دارد. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژن­های ذکر شده در ایجاد وزن تخم ­مرغ، می­توان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات وزن تخم مرغ را تأیید کرد.

Keywords

• پویش ژنومی
• روش بیزی
• ژن کاندیدا
• وزن تخم‌ مرغ